Journal
/
Genetics
/
Демонстрация выравнивания последовательностей для прогнозирования восприимчивости различных видов для быстрой оценки сохранения белка
JoVE Journal
Genetics
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Genetics
Demonstration of the Sequence Alignment to Predict Across Species Susceptibility Tool for Rapid Assessment of Protein Conservation
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Демонстрация выравнивания последовательностей для прогнозирования восприимчивости различных видов для быстрой оценки сохранения белка

русский

Automatically Generated

2,371 Views

•

16:02 min

•

February 10, 2023

DOI:

10.3791/63970-v

DOI:
10.3791/63970-v

•

16:02 min
February 10, 2023

•

9 Views
, , , , , , , ,
1Office of Research and Development, Center for Computational Toxicology and Exposure, Scientific Computing and Data Curation Division,U.S. Environmental Protection Agency, 2Oak Ridge Institute for Science and Education, 3Swenson College of Science and Engineering, Department of Biology,University of Minnesota Duluth, 4University of Wisconsin-Madison Aquatic Sciences Center, 5General Dynamics Information Technology,Research Triangle Park, 6Office of Research and Development, Center for Computational Toxicology and Exposure, Great Lakes Toxicology and Ecology Division,U.S. Environmental Protection Agency

Summary

Automatically generated

Здесь мы представляем протокол для использования последней версии инструмента Агентства по охране окружающей среды США По согласованию последовательностей для прогнозирования восприимчивости к видам (SeqAPASS). Этот протокол демонстрирует применение онлайн-инструмента для быстрого анализа сохранения белка и предоставления настраиваемых и легко интерпретируемых прогнозов химической восприимчивости у разных видов.

Explore More Videos

Sequence AlignmentProtein ConservationSeqAPASSCross-species ExtrapolationToxicity PredictionBiological PathwayProtein TargetProtein AccessionWeb-based InterfaceSpecies SensitivityChemical Susceptibility

Read Article

Cite this Article

Vliet, S. M. F., Hazemi, M., Blatz, D., Jensen, M., Mayasich, S., Transue, T. R., Simmons, C., Wilkinson, A., LaLone, C. A. Demonstration of the Sequence Alignment to Predict Across Species Susceptibility Tool for Rapid Assessment of Protein Conservation. J. Vis. Exp. (192), e63970, doi:10.3791/63970 (2023).

Download .ris file

Copy

Share Video

.

Copy