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Detección de transcripciones de ARN de proteína antisentido (VIH-1) de proteína antisentido (VIH-1) en pacientes por RT-PCR específico de Hebra
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Detection of Human Immunodeficiency Virus Type 1 (HIV-1) Antisense Protein (ASP) RNA Transcripts in Patients by Strand-Specific RT-PCR
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Detección de transcripciones de ARN de proteína antisentido (VIH-1) de proteína antisentido (VIH-1) en pacientes por RT-PCR específico de Hebra

español

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08:01 min

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November 27, 2019

DOI:

10.3791/60511-v

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10.3791/60511-v

•

08:01 min
November 27, 2019

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1Division of Immunology and Allergy,Lausanne University Hospital, 2Department of Fundamental Neuroscience,University of Lausanne, 3Department of Biochemistry,Erasmus Medical Center, 4Theoretical Biology and Biophysics Group,Los Alamos National Laboratories, 5Department of Biochemistry,University of Lausanne

Summary

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Las horquillas y bucles de ARN pueden funcionar como imprimaciones para la transcripción inversa (RT) en ausencia de imprimaciones específicas de secuencia, interfiriendo con el estudio de transcripciones antisentido superpuestas. Hemos desarrollado una técnica capaz de identificar el ARN específico de las hebras, y lo hemos utilizado para estudiar la proteína antisentido VIH-1 ASP.

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HIV-1Antisense Protein (ASP)RNA TranscriptsStrand-specific RT-PCRSense And Antisense SequencesBiotinylated PrimersRNA DenaturationAnti-sense CDNAsOverlapping GenesQuantificationDNase TreatmentReverse TranscriptionEndogenous RT ControlsReaction MixtureMagnetic BeadsWashing And Binding Buffer

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Mancarella, A., Procopio, F. A., Achsel, T., De Crignis, E., Foley, B. T., Corradin, G., Bagni, C., Pantaleo, G., Graziosi, C. Detection of Human Immunodeficiency Virus Type 1 (HIV-1) Antisense Protein (ASP) RNA Transcripts in Patients by Strand-Specific RT-PCR. J. Vis. Exp. (153), e60511, doi:10.3791/60511 (2019).

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