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Détection des transcriptions de l'ARN de type 1 (VIH-1) de protéine antisens (ASP) de détection du virus de l'immunodéficience humaine
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Detection of Human Immunodeficiency Virus Type 1 (HIV-1) Antisense Protein (ASP) RNA Transcripts in Patients by Strand-Specific RT-PCR
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Détection des transcriptions de l'ARN de type 1 (VIH-1) de protéine antisens (ASP) de détection du virus de l'immunodéficience humaine

français

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08:01 min

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November 27, 2019

DOI:

10.3791/60511-v

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10.3791/60511-v

•

08:01 min
November 27, 2019

•

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1Division of Immunology and Allergy,Lausanne University Hospital, 2Department of Fundamental Neuroscience,University of Lausanne, 3Department of Biochemistry,Erasmus Medical Center, 4Theoretical Biology and Biophysics Group,Los Alamos National Laboratories, 5Department of Biochemistry,University of Lausanne

Summary

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Les épingles à cheveux et les boucles d'ARN peuvent fonctionner comme amorces pour la transcription inverse (RT) en l'absence des amorces séquence-spécifiques, interférant avec l'étude des transcriptions antisense de chevauchement. Nous avons mis au point une technique capable d'identifier l'ARN spécifique aux brins, et nous l'avons utilisée pour étudier la protéine antisens HIV-1 ASP.

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HIV-1Antisense Protein (ASP)RNA TranscriptsStrand-specific RT-PCRSense And Antisense SequencesBiotinylated PrimersRNA DenaturationAnti-sense CDNAsOverlapping GenesQuantificationDNase TreatmentReverse TranscriptionEndogenous RT ControlsReaction MixtureMagnetic BeadsWashing And Binding Buffer

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Mancarella, A., Procopio, F. A., Achsel, T., De Crignis, E., Foley, B. T., Corradin, G., Bagni, C., Pantaleo, G., Graziosi, C. Detection of Human Immunodeficiency Virus Type 1 (HIV-1) Antisense Protein (ASP) RNA Transcripts in Patients by Strand-Specific RT-PCR. J. Vis. Exp. (153), e60511, doi:10.3791/60511 (2019).

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