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Basati sulla spettrometria di massa proteomica analisi utilizzando il Database di OpenProt a svelare nuove proteine tradotte da Non-Canonical Open Reading Frames
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Mass Spectrometry-Based Proteomics Analyses Using the OpenProt Database to Unveil Novel Proteins Translated from Non-Canonical Open Reading Frames
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Basati sulla spettrometria di massa proteomica analisi utilizzando il Database di OpenProt a svelare nuove proteine tradotte da Non-Canonical Open Reading Frames

italiano

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07:38 min

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April 11, 2019

DOI:

10.3791/59589-v

DOI:
10.3791/59589-v

•

07:38 min
April 11, 2019

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1Department of Biochemistry,Université de Sherbrooke, 2PROTEO,Quebec Network for Research on Protein Function, Structure, and Engineering

Summary

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OpenProt è un database liberamente accessibile che applica un modello di polycistronic dei genomi eucariotici. Qui, presentiamo un protocollo per l'utilizzo di database OpenProt quando interrogare i set di dati di spettrometria di massa. Utilizzo di OpenProt database per l'analisi di esperimenti di proteomica consente per la scoperta del romanzo e proteine precedentemente non rilevabili.

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Brunet, M. A., Roucou, X. Mass Spectrometry-Based Proteomics Analyses Using the OpenProt Database to Unveil Novel Proteins Translated from Non-Canonical Open Reading Frames. J. Vis. Exp. (146), e59589, doi:10.3791/59589 (2019).

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