Multi-locus Variable-number Tandem-repeat Analysis of the Fish-pathogenic Bacterium <em>Yersinia ruckeri</em> by Multiplex PCR and Capillary Electrophoresis

Snorre Gulla; Saima  Nasrin Mohammad; Duncan  John Colquhoun

doi:10.3791/59455

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Multi-locus Nombre variable Tandem-répétition Analyse du Bacterium Yersinia ruckeri par Multiplex PCR et Capillary Electrophoresis

JoVE Journal
Genetics

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Multi-locus Variable-number Tandem-repeat Analysis of the Fish-pathogenic Bacterium Yersinia ruckeri by Multiplex PCR and Capillary Electrophoresis

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Multi-locus Nombre variable Tandem-répétition Analyse du Bacterium Yersinia ruckeri par Multiplex PCR et Capillary Electrophoresis

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•

10:33 min

•

June 17, 2019

DOI:

10.3791/59455-v

DOI:

10.3791/59455-v

•

10:33 min

June 17, 2019

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Snorre Gulla¹, Saima Nasrin Mohammad¹, Duncan John Colquhoun^1,2

¹Fish Health Research Group,Norwegian Veterinary Institute, ²University of Bergen

Summary

L'analyse multilocus à répétition en tandem (MLVA) présentée ici permet un génotypage à haute résolution peu coûteux, robuste et portable de la bactérie poisson-pathogène Yersinia ruckeri. Partant de cultures pures, l'essai utilise le multiplex PCR et l'électrophoresis capillaire pour produire des profils MLVA à dix loci pour des applications en aval.

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Yersinia Ruckeri Multi-locus Variable-number Tandem-repeat Analysis Multiplex PCR Capillary Electrophoresis Genotyping Epidemiology Population Structure Diagnostic Specificity Infection Tracing Virulent Clones Environmental Strains

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