نقدم هنا، وضع بروتوكول للسماح للقياس الكمي الدقيق من الميتوكوندريا الحمض النووي (متدنا) مثلايشن. في هذا البروتوكول، يصف لنا هضم الأنزيمي للحمض النووي مع بامهي مقترنة بخط أنابيب تحليل bioinformatic التي يمكن استخدامها لتجنب المبالغة في تقدير مستويات مثلايشن متدنا الناجم عن هيكل متدنا الثانوية.