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Ultralow genoma entrada biblioteca preparação de um único espécime Tardigrade de sequenciamento
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Ultralow Input Genome Sequencing Library Preparation from a Single Tardigrade Specimen

Ultralow genoma entrada biblioteca preparação de um único espécime Tardigrade de sequenciamento

português

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10:28 min

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July 15, 2018

DOI:

10.3791/57615-v

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10.3791/57615-v

•

10:28 min
July 15, 2018

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1Institute for Advanced Biosciences,Keio University, 2Systems Biology Program, Graduate School of Media and Governance,Keio University, 3Faculty of Environment and Information Studies,Keio University

Summary

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Contaminação durante o sequenciamento de genoma de organismos microscópicos continua a ser um grande problema. Aqui, nós mostramos um método para sequenciar o genoma de um Tardigrada de um único espécime com tão pouco quanto 50 pg de DNA genômico sem amplificação do genoma inteiro para minimizar o risco de contaminação.

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TardigradeGenome SequencingSingle SpecimenUltralow InputGenomic DNAHomogenizationFreeze-thawPipette CrushingLibrary PreparationMiSeq SequencingBacterial ContaminationAntibioticsAgarose GelMicroscopyLysis BufferDNA Extraction

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Yoshida, Y., Konno, S., Nishino, R., Murai, Y., Tomita, M., Arakawa, K. Ultralow Input Genome Sequencing Library Preparation from a Single Tardigrade Specimen. J. Vis. Exp. (137), e57615, doi:10.3791/57615 (2018).

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