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単一細胞のシーケンシングを使用したコピー数変化の検出

JoVE Journal
Genetics

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JoVE Journal Genetics

Detection of Copy Number Alterations Using Single Cell Sequencing

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単一細胞のシーケンシングを使用したコピー数変化の検出

DOI:

10.3791/55143-v

•

09:45 min

•

February 17, 2017

•

Kristin A. Knouse^2,3, Jie Wu, Austin Hendricks

¹Koch Institute for Integrative Cancer Research, Department of Biology,Massachusetts Institute of Technology, ²Howard Hughes Medical Institute, ³Division of Health Sciences and Technology,Harvard Medical School, ⁴The Barbara K. Ostrom (1978) Bioinformatics and Computing Facility in the Swanson Biotechnology Center, Koch Institute for Integrative Cancer Research,Massachusetts Institute of Technology, ⁵BioMicro Center, Department of Biology,Massachusetts Institute of Technology

Chapters

00:05Title
00:48Preparation of Aspirator
04:34Whole Genome Amplification
07:39Results: Detection of Copy Number Alterations Using Single Cell Sequencing
08:48Conclusion

Summary

Automatic Translation

単一細胞配列決定は、高解像度でゲノムの変化に対処するため、ますます人気とアクセス可能なツールです。我々は、単一の細胞内のコピー数の変化を識別するために、単一細胞の配列決定を使用するプロトコルを提供します。

Tags

Single Cell Sequencing Copy Number Alterations Genomic Heterogeneity Cytologic Approaches Sensitivity Specificity Micro-aspirator Syringe Filter PVC Tubing Serological Pipette Glass Capillary Tube Whole Genome Amplification Adherence Cells Trypsinization 10% Bleach 70% Ethanol

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