Мы описываем методологию для выполнения генетического анализа в Chlamydia на основе химического мутагенеза и секвенирование целого генома. Кроме того, система ДНК обмена в инфицированных клетках описано, что могут быть использованы для генетического картирования. Этот метод может быть широко применима к микробных системах без системы трансформации и молекулярно-генетические инструменты.