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Haute profilage de microARN Débit: Multiplex Optimisé qRT-PCR à l'échelle nanolitres sur l'IFC de Fluidigm ArrayTM dynamique
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August 03, 2011
DOI:
1The Eli and Edythe Broad Center of Regeneration Medicine and Stem Cell Research,University of California San Francisco , 2Center for Reproductive Sciences,University of California San Francisco , 3Department of Urology,University of California San Francisco , 4Department of Cell and Tissue Biology,University of California San Francisco , 5Fluidigm Corporation,Fluidigm Corporation , 6Department of Obstetrics and Gynecology,Hadassah-Hebrew University Medical Center, 7UCSF – Helen Diller Family Comprehensive Cancer Center,University of California San Francisco
Summary
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Nous décrivons ici une inversion optimisé multiplexe transcriptase PCR quantitative (qRT-PCR) en combinaison avec le protocole d'une plateforme microfluidique comme un coût et le temps moyen efficace de dépistage à haut débit pour microARN (miARN) les niveaux d'expression, surtout quand on travaille avec des quantités limitées de l'échantillon.
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High Throughput MicroRNA ProfilingMultiplex QRT-PCRFluidigm Dynamic ArrayTM IFCsMiRNAsQuantificationMicroRNA LevelsWild-typeSmall RNA Deficient Mouse Embryonic Stem Cells (mESC)AccuracyRobustnessOptimized MethodPurifying PrimersSingleplex Real-time DetectionMicrofluidic ChipNanoliter VolumesReagent CostsHigh Throughput MiRNA Expression Profiling
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Moltzahn, F., Hunkapiller, N., Mir, A. A., Imbar, T., Blelloch, R. High Throughput MicroRNA Profiling: Optimized Multiplex qRT-PCR at Nanoliter Scale on the Fluidigm Dynamic ArrayTM IFCs. J. Vis. Exp. (54), e2552, doi:10.3791/2552 (2011).
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