Journal
/
Immunology and Infection
/
Inférence génotypique de tropisme du VIH-1 en utilisant la population basée séquençage du V3
JoVE Journal
Immunology and Infection
This content is Free Access.
JoVE Journal Immunology and Infection
Genotypic Inference of HIV-1 Tropism Using Population-based Sequencing of V3
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Inférence génotypique de tropisme du VIH-1 en utilisant la population basée séquençage du V3

DOI:
10.3791/2531-v

•

11:10 min

•

December 27, 2010

•

, ,
1Laboratory Program,BC Centre for Excellence in HIV/AIDS

Chapters

  • 00:05Title
  • 01:25Amplification of HIV cDNA from Blood Plasma
  • 03:37Gel Electrophoresis
  • 04:29Sequencing
  • 07:18Data Analysis with Base Calling Software
  • 08:18The Geno2pheno Co-receptor Algorithm
  • 09:37Interpreting the Geno2pheno FPR
  • 10:37Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

VIH tropisme peut être déduite de la région V3 de l'enveloppe virale. V3 est amplifié par PCR en triple en utilisant RT-PCR nichée, séquencé, et interprétées en utilisant un logiciel de bioinformatique. Les échantillons ayant des séquences 1 ou plusieurs (s) avec des scores faibles G2P sont classés comme non-virus R5.

Tags

HIV-1 TropismGenotypic InferencePopulation-based SequencingV3 RegionCCR5-antagonistViral PopulationCoreceptorTropism TestingViral RNAReverse Transcriptase-PCRSoftware AnalysisRE CallBioinformatic AlgorithmGeno2phenoFalse Positive Rate

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

check_url/2531?article_type=v

Évaluation des immunologiquement pertinents dynamiques tertiaires Caractéristiques structurelles de l'épidémie de VIH-1 séquence de la boucle V3 de la Couronne par R2<em> Ab initio</em> Pliante
check_url/2531?article_type=v

Marquage spécifique du VIH-1 des cellules positives à l'aide d'un vecteur Rev-dépendante lentiviraux exprimant la protéine fluorescente verte
check_url/2531?article_type=v

Prédiction du VIH-1 Utilisation corécepteur (tropisme) par analyse de séquence en utilisant une approche génotypique
check_url/2531?article_type=v

En décapsidation in vitro du VIH-1 Cores
check_url/2531?article_type=v

De nouveaux outils pour multiplier des cellules T régulatrices de personnes VIH-1-infected
check_url/2531?article_type=v

L'évaluation de l'Innate détection du VIH-1 CD4 infectés<sup> +</sup> Cellules T par les cellules dendritiques plasmacytoïdes Utilisation d'un<em> Ex vivo</em> Système de co-culture.
check_url/2531?article_type=v

Évaluation de conformation du VIH-1 trimère glycoprotéines d'enveloppe l'aide d'un base de cellules test ELISA
check_url/2531?article_type=v

Isolement des exosomes dans le plasma du VIH-1 individus positifs
check_url/2531?article_type=v

Visualisation du VIH-1 Gag Reliure Giant unilamellaires vésiculaires (GUV) Membranes
check_url/2531?article_type=v

Mesure de<em> In vitro</em> Activité d'intégration du VIH-1 préintégration Complexes

Read Article