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Modelado de estructuras cuaternarias a través de espectrometría de masas de reticulación química: ampliación de los informes de JUpyter TX-MS
1Equipe Signalisation Calcique et Infections Microbiennes,Ecole Normale Supérieure Paris-Saclay, 2Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale, 3Scientific IT Services,ETH Zurich, 4Institute for Computational Science,University of Zurich, 5S3IT,University of Zurich, 6Division of Infection Medicine, Department of Clinical Sciences Lund, Faculty of Medicine,Lund University
Bölümler
- 00:04Introduction
- 00:47Targeted Cross-Linking Mass Spectrometry (TX-MS)
- 02:21JupyterHub Installation
- 02:51Report Download
- 03:30Report Extension and Uploading
- 03:50Results: Representative Structural Model of Streptococcus Pyogenes Protein M1 and Human Albumin with XLs Mapped on the Structure
- 04:18Conclusion
La espectrometría de masas de reticulación dirigida crea modelos de estructura de proteínas cuaternarias utilizando datos de espectrometría de masas adquiridos utilizando hasta tres protocolos de adquisición diferentes. Cuando se ejecuta como un flujo de trabajo simplificado en el servidor web Cheetah-MS, los resultados se informan en un Jupyter Notebook. Aquí, demostramos los aspectos técnicos de cómo se puede extender el Jupyter Notebook para un análisis más profundo.
