This content is Free Access.
Моделирование четвертичной структуры с помощью химической поперечной масс-спектрометрии: расширение отчетов TX-MS Jupyter
2,191 Views
•
05:18 min
•
October 20, 2021
DOI:
1Equipe Signalisation Calcique et Infections Microbiennes,Ecole Normale Supérieure Paris-Saclay, 2Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale, 3Scientific IT Services,ETH Zurich, 4Institute for Computational Science,University of Zurich, 5S3IT,University of Zurich, 6Division of Infection Medicine, Department of Clinical Sciences Lund, Faculty of Medicine,Lund University
Özet
Automatically generated
Целевая сшивающая масс-спектрометрия создает четвертичные модели структуры белка с использованием данных масс-спектрометрии, полученных с использованием до трех различных протоколов сбора. При выполнении в виде упрощенного рабочего процесса на веб-сервере Cheetah-MS результаты отображаются в записной книжке Jupyter. Здесь мы демонстрируем технические аспекты того, как Jupyter Notebook может быть расширен для более глубокого анализа.
Read Article
Cite this Article
Khakzad, H., Vermeul, S., Malmström, L. Quaternary Structure Modeling Through Chemical Cross-Linking Mass Spectrometry: Extending TX-MS Jupyter Reports. J. Vis. Exp. (176), e60311, doi:10.3791/60311 (2021).
Copy