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化学架橋質量分析による第四次構造モデリング:TX-MSジュピターレポートの拡張
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05:18 min
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October 20, 2021
DOI:
1Equipe Signalisation Calcique et Infections Microbiennes,Ecole Normale Supérieure Paris-Saclay, 2Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale, 3Scientific IT Services,ETH Zurich, 4Institute for Computational Science,University of Zurich, 5S3IT,University of Zurich, 6Division of Infection Medicine, Department of Clinical Sciences Lund, Faculty of Medicine,Lund University
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標的架橋質量分析は、最大3つの異なる取得プロトコルを使用して取得した質量分析データを使用して、第4級タンパク質構造モデルを作成します。Cheetah-MS Webサーバーで簡略化されたワークフローとして実行すると、結果はJupyter Notebookに報告されます。ここでは、Jupyter ノートブックを拡張してより詳細な分析を行う方法の技術的な側面を示します。
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Khakzad, H., Vermeul, S., Malmström, L. Quaternary Structure Modeling Through Chemical Cross-Linking Mass Spectrometry: Extending TX-MS Jupyter Reports. J. Vis. Exp. (176), e60311, doi:10.3791/60311 (2021).
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