This content is Free Access.
نمذجة البنية الرباعية من خلال قياس الطيف الكتلي المتقاطع الكيميائي: توسيع تقارير TX-MS Jupyter
1Equipe Signalisation Calcique et Infections Microbiennes,Ecole Normale Supérieure Paris-Saclay, 2Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale, 3Scientific IT Services,ETH Zurich, 4Institute for Computational Science,University of Zurich, 5S3IT,University of Zurich, 6Division of Infection Medicine, Department of Clinical Sciences Lund, Faculty of Medicine,Lund University
Bölümler
- 00:04Introduction
- 00:47Targeted Cross-Linking Mass Spectrometry (TX-MS)
- 02:21JupyterHub Installation
- 02:51Report Download
- 03:30Report Extension and Uploading
- 03:50Results: Representative Structural Model of Streptococcus Pyogenes Protein M1 and Human Albumin with XLs Mapped on the Structure
- 04:18Conclusion
ينشئ قياس الطيف الكتلي المستهدف المتقاطع نماذج بنية البروتين الرباعية باستخدام بيانات قياس الطيف الكتلي التي تم الحصول عليها باستخدام ما يصل إلى ثلاثة بروتوكولات اكتساب مختلفة. عند التنفيذ كسير عمل مبسط على خادم الويب Cheetah-MS ، يتم الإبلاغ عن النتائج في دفتر ملاحظات Jupyter. هنا ، نوضح الجوانب الفنية لكيفية توسيع Jupyter Notebook لإجراء تحليل أكثر تعمقا.
