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RNA의 발자국 의 식별:연속RNA 면역 침전을 통한 단백질 복합체 시퀀싱 (RIPiT-Seq)
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Identification of Footprints of RNA:Protein Complexes via RNA Immunoprecipitation in Tandem Followed by Sequencing (RIPiT-Seq)
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RNA의 발자국 의 식별:연속RNA 면역 침전을 통한 단백질 복합체 시퀀싱 (RIPiT-Seq)

DOI:
10.3791/59913-v

•

09:26 min

•

July 10, 2019

•

, ,
1Department of Molecular Genetics, Center for RNA Biology,The Ohio State University

Bölümler

  • 00:04Başlık
  • 01:40Cell Harvesting and Formaldehyde Treatment
  • 02:50FLAG Immunoprecipitation and RNase I Digestion
  • 04:09Affinity Elution and Magnetic Bead-antibody Conjugation
  • 05:14Second Immunoprecipitation
  • 06:12RNA Extraction and Analysis
  • 07:51Results: RNA and Protein Yields
  • 08:38Conclusion

Özet

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여기에서, 우리는 포유류 세포에서 내인성 RNA 결합 사이트 또는 RNA의 "발자국"을 풍부하게 하는 프로토콜을 제시합니다:단백질 (RNP) 복합체. 이 접근은 RNP 소단위의 2개의 면역 강절을 관련시키고 그러므로 나란히 RNA 면역 침전이라고 불립니다 (RIPiT).

Etiketler

RNA ImmunoprecipitationRIPiT-SeqRNA-protein ComplexesEpitope-tagged ProteinCRISPRImmunoprecipitationRNA ExtractionHEK293 CellsRNA Binding ProteinsRNA ProcessingDiseasesNeuropathiesCancer

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