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규제 RNA 결합 단백질에 대한 결합 부위를 식별하기 위한 서열 공간 탐색
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Exploring Sequence Space to Identify Binding Sites for Regulatory RNA-Binding Proteins
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규제 RNA 결합 단백질에 대한 결합 부위를 식별하기 위한 서열 공간 탐색

DOI:
10.3791/59635-v

•

11:34 min

•

August 09, 2019

•

1Department of Molecular, Cellular and Developmental Biology,University of Colorado at Boulder

Bölümler

  • 00:04Başlık
  • 01:11Generation of DNA Random Library Pool
  • 02:14Synthesis of Pool 0 RNA
  • 04:58RNA-Protein Binding Reaction and Separation of Bound RNA
  • 08:35Reverse Transcription, PCR Amplification, and Protein Binding
  • 09:47Results: Enrichment of PTB-binding RNAs and Splice Site Switching Assay
  • 10:50Conclusion

Özet

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서열 특이성은 유전자 조절에 매우 중요합니다. 특정 서열을 인식하는 조절 단백질은 유전자 조절에 중요합니다. 이러한 단백질에 대한 기능적 결합 부위를 정의하는 것은 어려운 생물학적 문제입니다. RNA 결합 단백질에 대한 결합 부위의 식별을 위한 반복적 접근법은 여기에 기재되어 있으며 모든 RNA 결합 단백질에 적용가능하다.

Etiketler

Sequence SpaceBinding SitesRegulatory RNA-binding ProteinsSaturation MutagenesisProtein-binding SiteDisease DiagnosisTherapyRandom LibraryRNA PoolBinding ReactionHigh AffinitySpecific BindersPCRT7 RNA PolymeraseTranscriptionGel PurificationAutoradiography

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