Dergi
/
Genetik
/
Explorer l'espace de séquence pour identifier les sites de liaison pour les protéines de liaison de l'ARN réglementaires
JoVE Journal
Genetik
Bu içeriği görüntülemek için JoVE aboneliği gereklidir.  Oturum açın veya ücretsiz deneme sürümünü başlatın.
JoVE Journal Genetik
Exploring Sequence Space to Identify Binding Sites for Regulatory RNA-Binding Proteins
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Explorer l'espace de séquence pour identifier les sites de liaison pour les protéines de liaison de l'ARN réglementaires

DOI:
10.3791/59635-v

•

11:34 min

•

August 09, 2019

•

1Department of Molecular, Cellular and Developmental Biology,University of Colorado at Boulder

Bölümler

  • 00:04Başlık
  • 01:11Generation of DNA Random Library Pool
  • 02:14Synthesis of Pool 0 RNA
  • 04:58RNA-Protein Binding Reaction and Separation of Bound RNA
  • 08:35Reverse Transcription, PCR Amplification, and Protein Binding
  • 09:47Results: Enrichment of PTB-binding RNAs and Splice Site Switching Assay
  • 10:50Conclusion

Özet

Otomatik Çeviri

Otomatik Çeviri

La spécificité de la séquence est essentielle à la régulation des gènes. Les protéines réglementaires qui reconnaissent des séquences spécifiques sont importantes pour la régulation des gènes. Définir des sites de liaison fonctionnels pour de telles protéines est un problème biologique difficile. Une approche itérative pour l'identification d'un site de liaison pour une protéine liant l'ARN est décrite ici et s'applique à toutes les protéines liant l'ARN.

Etiketler

Sequence SpaceBinding SitesRegulatory RNA-binding ProteinsSaturation MutagenesisProtein-binding SiteDisease DiagnosisTherapyRandom LibraryRNA PoolBinding ReactionHigh AffinitySpecific BindersPCRT7 RNA PolymeraseTranscriptionGel PurificationAutoradiography

Article

Embed

ÇALMA LİSTESİNE EKLE

Usage Statistics

İlgili Videolar

Méthyl-liaison par capture d'ADN de séquençage pour les tissus du patient

Novel protéines __gVirt_NP_NN_NNPS<__ ARN-Binding Isolation par la méthodologie RaPID

Conjugatif Mating Assays pour l'analyse des protéines de transfert impliqués dans Conjugaison bactérienne spécifique à la séquence

Peptide dérivé Méthode du transport des gènes et des protéines Across cellulaire et obstacles organites dans les plantes

Analyse des protéines Cap-liaison dans les cellules humaines exposées à des conditions physiologiques de l'oxygène

Numérisation Retroviral: Mapping des sites d'intégration MLV pour définir des régions réglementaires spécifiques à une cellule

Analyse en temps réel du facteur de Transcription Binding, Transcription, traduction et chiffre d’affaires pour afficher des événements mondiaux au cours de l’Activation cellulaire

Formaldéhyde-assisted isolement des éléments régulateurs à mesure accessibilité de la chromatine dans les cellules de mammifères

Une approche de mutagenèse roman Saturation : Seule étape caractérisation des protéines régulatrices accepteurs en ARN utilisant Phosphorothioates

High-throughput Identification des séquences régulatrices du gène à l’aide de prochaine génération séquençage du Chromosome circulaire Conformation Capture (4C-seq)

Read Article