Микробные биопленки образуют сложные архитектуры на межфазах и превращаются в сильно зависящие от масштаба пространственные узоры. Здесь мы внедряем экспериментальную систему (жесткое и программное обеспечение) для автоматизированного приобретения наборов 3D оптической когересцены (OCT). Этот набор инструментов позволяет неинвазивную и многомасштабную характеристику биопленки морфогенеза в пространстве и времени.