Summary

Purificación y caracterización biofísica de la miosina-7a humana basada en el sistema MultiBac

Published: August 23, 2024
doi:

Summary

Este protocolo detalla los procedimientos para la producción recombinante de la holoenzima miosina-7a humana utilizando el sistema MultiBac Baculovirus y para el estudio de su motilidad utilizando un ensayo de deslizamiento de filamento in vitro a medida.

Abstract

La miosina-7a es una proteína motora basada en actina vital para los procesos auditivos y visuales. Las mutaciones en la miosina-7a conducen al síndrome de Usher tipo 1, la forma más común y grave de sordoceguera en los seres humanos. Se plantea la hipótesis de que la miosina-7a forma un complejo de adhesión transmembrana con otras proteínas de Usher, esencial para la integridad estructural-funcional de las células ciliadas fotorreceptoras y cocleares. Sin embargo, debido a los desafíos para obtener proteínas puras e intactas, los mecanismos funcionales exactos de la miosina-7a humana siguen siendo difíciles de alcanzar, con estudios estructurales y biomecánicos limitados disponibles. Estudios recientes han demostrado que la miosina-7a de los mamíferos es un complejo motor multimérico formado por una cadena pesada y tres tipos de cadenas ligeras: cadena ligera reguladora (RLC), calmodulina y proteína 4 similar a la calmodulina (CALML4). A diferencia de la calmodulina, CALML4 no se une a los iones de calcio. Tanto las calmodulinas sensibles al calcio como las insensibles son críticas para la miosina-7a de los mamíferos para el ajuste adecuado de sus propiedades mecánicas. Aquí, describimos un método detallado para producir holoenzima de miosina-7a humana recombinante utilizando el sistema de expresión de proteínas MultiBac Baculovirus. Esto produce cantidades de miligramos de proteína completa de alta pureza, lo que permite su caracterización bioquímica y biofísica. Además, presentamos un protocolo para evaluar sus propiedades mecánicas y móviles utilizando ensayos de motilidad in vitro y microscopía de fluorescencia. La disponibilidad de la proteína miosina-7a humana intacta, junto con el protocolo detallado de caracterización funcional descrito aquí, allana el camino para futuras investigaciones sobre los aspectos moleculares de la miosina-7a en la visión y la audición.

Introduction

Las miosinas son proteínas motoras moleculares que interactúan con la actina para impulsar numerosos procesos celulares 1,2,3,4. Los seres humanos poseen 12 clases y 39 genes de miosina5, que están involucrados en una amplia gama de funciones fisiológicas, como la contracción muscular6 y los procesos sensoriales7. Cada molécula de miosina es un complejo multimérico compuesto por una cadena pesada y cadenas ligeras. La cadena pesada se divide en regiones de cabeza, cuello y cola. La cabeza contiene sitios de unión a actina y nucleótidos que son responsables de la hidrólisis del ATP y de la generación de fuerza sobre los filamentos de actina2. El mástil está formado por varios motivos IQ α-helicoidales donde se unen un conjunto específico de cadenas ligeras. Juntos funcionan como un brazo de palanca para amplificar los cambios conformacionales del motor en grandes movimientos 8,9,10. La cola contiene subdominios específicos de cada clase y desempeña un papel regulador en el ajuste de la actividad motora de la miosina y en la mediación de las interacciones con los socios de unión celular 2,11.

La miosina-7a humana, miembro de las miosinas de clase 7, es esencial para los procesos auditivos y visuales12,13. Los motivos de CI de la miosina-7a humana se asocian con una combinación única de cadenas ligeras, que incluyen la cadena ligera reguladora (RLC), la calmodulina y la proteína similar a la calmodulina 4 (CALML4)14,15,16. Además de estabilizar el brazo de palanca, estas cadenas ligeras regulan las propiedades mecánicas de la miosina-7a en respuesta a la señalización del calcio, una característica que parece ser exclusiva de la isoforma14 de los mamíferos.

Los defectos en el gen que codifica la cadena pesada de miosina-7a (MYO7A/USH1B) son responsables del síndrome de Usher tipo 1, la forma más grave de pérdida combinada de visión y audición en humanos17. Además, el gen de cadena ligera CALML4 se encuentra entre los genes candidatos mapeados para contener el alelo causante de USH1H, otra variante del síndrome de Usher tipo 115,18. En la retina, la miosina-7a se expresa en el epitelio pigmentario de la retina y en las células fotorreceptoras13. Se ha implicado en la localización de melanosomas en el epitelio pigmentario de la retina (EPR)19 y en la fagocitosis de los discos del segmento externo de los fotorreceptores por parte de las célulasEPRP20. En el oído interno, la miosina-7a se encuentra principalmente en los estereocilios, donde desempeña un papel fundamental en la formación de mechones pilosos y en la activación del proceso de transducción mecanoeléctrica 12,21,22.

Si bien la importancia de la miosina-7a en las células sensoriales está bien establecida, sus mecanismos funcionales a nivel molecular siguen siendo poco conocidos. Esta brecha en el conocimiento se debe en parte a los desafíos para purificar la proteína intacta, especialmente la isoforma de mamíferos. Recientemente, se han realizado avances significativos utilizando el sistema MultiBac para expresar de forma recombinante la holoenzima14 de miosina-7a humana completa. Este avance ha permitido caracterizaciones estructurales y biofísicas de esta proteína motora, lo que ha llevado al descubrimiento de varias propiedades únicas de la miosina-7a humana que están específicamente adaptadas para las funciones auditivas de los mamíferos14,23.

El sistema MultiBac es una plataforma avanzada de células de baculovirus/insectos diseñada específicamente para la expresión de complejos multiméricos eucariotas24,25. Una característica clave de este sistema es su capacidad para albergar múltiples casetes de expresión génica, cada uno de los cuales codifica una subunidad del complejo, dentro de un único baculovirus MultiBac. El ensamblaje de los casetes de expresión multigénica se facilita a través de un módulo de multiplicación: un sitio de endonucleasa (HE) y un sitio BstXI de diseño coincidente que flanquea los sitios de clonación múltiple (MCS). Este módulo permite el ensamblaje iterativo de un casete de expresión única por restricción/ligadura, aprovechando el hecho de que los sitios de restricción HE y BstXI se eliminan tras su ligadura. En este artículo, la cadena pesada de miosina-7a humana, RLC, calmodulina y CALML4 se clonan en el módulo de multiplicación dentro del vector pACEBac1 (Figura 1A), que luego se ensamblan en un casete de expresión multigénica a través del proceso iterativo (Figura 1B). El casete multigénico de miosina-7a se integra en el genoma baculoviral (bacmid) a través de la transposición del elemento mini-Tn7 del vector pACEBac1 al sitio diana mini-attTn7 en el genoma (Figura 1C). Siguiendo los procedimientos para la purificación de bacmid, la producción y amplificación de baculovirus (Figura 1D, E), se prepara el baculovirus MultiBac de miosina-7a recombinante y se puede utilizar para la producción de proteínas a gran escala (Figura 1F). Además, las cadenas ligeras de miosina-7a pueden producirse por separado en E. coli y purificarse utilizando una etiqueta His6-SUMO escindible 26,27,28. Las cadenas ligeras purificadas son útiles para estudiar su dinámica de unión y regulación de la miosina-7a.

La proteína miosina-7a purificada puede someterse a estudios estructurales, bioquímicos y biofísicos para obtener información sobre la regulación estructural-funcional de esta proteína motora. Además, sus interacciones con la red de actina y otras proteínas de unión29 pueden examinarse utilizando una variedad de enfoques de reconstitución in vitro. Los hallazgos de estos análisis informarán sobre las propiedades biofísicas de esta miosina, lo que conducirá a una comprensión mecanicista de cómo la miosina-7a impulsa los cambios en el citoesqueleto y, en última instancia, da forma a la morfología y función únicas de las células sensoriales. En este artículo, detallamos un flujo de trabajo para el ensayo de deslizamiento de filamento de actina que se ha adaptado específicamente para la miosina-7a de mamíferos. El ensayo de deslizamiento de filamentos de actina es un robusto ensayo de motilidad in vitro que estudia cuantitativamente el movimiento de filamentos de actina fluorescentes propulsados por un gran número de motores de miosina inmovilizados en una superficie de cubreobjetos 30,31,32. Las ventajas de este ensayo incluyen su simplicidad de configuración, requisitos mínimos de equipo (un microscopio de fluorescencia de campo amplio equipado con una cámara digital) y alta reproducibilidad. Además, debido a que el movimiento de los filamentos de actina es impulsado por un grupo de motores de miosina inmovilizados, este ensayo es particularmente útil para estudiar la motilidad de miosinas monoméricas como la miosina-7a14,33. Los protocolos incluyen varias modificaciones, desde procedimientos experimentales hasta análisis de imágenes, específicamente adaptados a las propiedades móviles únicas de la miosina-7a de los mamíferos. Con la disponibilidad de la proteína miosina-7a intacta y el protocolo de caracterización funcional descrito aquí, este artículo sienta las bases para una mayor investigación sobre las funciones moleculares de la miosina-7a en procesos fisiológicos y patológicos.

Protocol

NOTA: Aquí describimos un protocolo para sintetizar la holoenzima miosina-7a humana intacta y caracterizar su motilidad in vitro. Este protocolo se divide en tres secciones: en primer lugar, la expresión de la miosina-7a humana mediante el sistema de expresión de proteínas del baculovirus MultiBac; En segundo lugar, purificar las cadenas ligeras de miosina-7a por separado utilizando el sistema E.coli His6-SUMO; y, por último, el estudio de la motilidad de la miosina-7a humana mediante el ensayo de deslizami…

Representative Results

El complejo de miosina-7a purificado y las proteínas de cadena ligera se pueden evaluar mediante electroforesis en gel SDS-PAGE, como se muestra en la Figura 3. La banda por encima del marcador de 200 kDa corresponde a la cadena pesada de miosina-7a (255 kDa). Las tres bandas que migran entre los marcadores de 22 y 14 kDa de arriba a abajo son RLC (20 kDa), calmodulina y CALML4, respectivamente. Mientras que la calmodulina y la CALML4 tienen un peso molecular similar de aproximadamente 17 k…

Discussion

Aquí se presenta un protocolo detallado para la producción de proteína recombinante de miosina-7a humana a partir de células de insectos. Aunque el sistema Sf9/baculovirus se ha utilizado para producir una variedad de miosinas 40,41,42,43, sólo recientemente se ha purificado con éxito la miosina-7a de mamíferos utilizando el sistema de baculovirus MultiBac 14. Se …

Disclosures

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

Agradecemos al Centro de Imágenes de Microscopía y al Centro de Función Visual y Morfología de la Universidad de Virginia Occidental por la discusión y la ayuda con el análisis de imágenes. Este trabajo cuenta con el apoyo de los fondos de inicio de la Facultad de Medicina de la Universidad de West Virginia para R.L. Este trabajo también cuenta con el apoyo del Centro de Excelencia en Investigación Biomédica (Vs-CoBRE) (P20GM144230) del Instituto Nacional de Ciencias Médicas Generales (NIGMS) y la Red de Excelencia en Investigación Biomédica de Virginia Occidental (WV-INBRE) (P20GM103434).

Materials

1.7 mL microcentrifuge tubes VWR 87003-294
1X FLAG Peptide GenScript N/A Custom peptide synthesis
22x22mm No. 1.5 coverslips VWR 48366-227
250 mL Conical Centrifuge Tubes Nunc 376814
250 mL Vented Erlenmyer Shaker Flask IntelixBio DBJ-SF250VP
2-Mercaptoethanol VWR M131
75x25x1 mm Vistavision microscope slides VWR 16004-42
Actin Protein (>99% Pure) Cytoskeleton AKL99
Amicon Ultra-0.5 Centrifugal Filter Unit Millipore Sigma UFC510024
Amicon Ultra-4 Centrifugal Filter Unit Millipore Sigma UFC801024
ANTI-FLAG M2 Affinity Gel Millipore Sigma A2220
ATP Millipore Sigma A7699
ATP Millipore Sigma A7699
Bio-Spin Disposable Chromatography Column Bio-Rad 732-6008
BL21 Competent E. coli New England Biolabs C2530H
Bluo-Gal Thermo Fisher 15519028
Bovine Serum Albumin Millipore Sigma 5470
BstXI Enzyme New England Biolabs R0113S
Calmodulin Millipore Sigma 208694
Catalase Millipore Sigma C40
Champion pET-SUMO Expression System Thermo Fisher K30001
cOmplete, EDTA-free Protease Inhibitor Cocktail Roche Diagnostics 5056489001
Cutsmart Buffer New England Biolabs B6004S
DL-Dithiothreitol Millipore Sigma DO632
DL-Dithiothreitol Millipore Sigma DO632
DNase I, Spectrum Chemical Fisher Scientific 18-610-304
Double-Sided Tape Office Depot 909955
EGTA, Molecular Biology Grade Millipore Sigma 324626-25GM
EGTA, Molecular Biology Grade Millipore Sigma 324626-25GM
Ethanol Thermo Fisher BP2818
ExpiFectamine Sf Transfection Reagent Gibco A38915
FAST program http://spudlab.stanford.edu/fast-for-automatic-motility-measurements; 
Fisherbrand Model 505 Sonic Dismembrator Fisher Scientific FB505110
Gentamicin Reagent Solution Gibco 15710-064 10 mg/mL in distilled water
Glucose Millipore Sigma G5767
Glucose Oxidase Millipore Sigma G2133
Glycerol Invitrogen 15514-011
HisPur Cobalt Resin Thermo Fisher 89966
I-CeuI Enzyme New England Biolabs R0699S
Image Stabilizer Plugin https://www.cs.cmu.edu/~kangli/code/Image_Stabilizer.html
ImageJ FIJI https://imagej.net/Fiji/Downloads
Imidazole Millipore Sigma I2399
In-Fusion Snap Assembly Master Mix TaKaRa 638948
IPTG Thermo Fisher 15529019
Isopropanol Fisher Scientific A451SK
Kanamycin Fisher Scientific AAJ67354AD
Large Orifice Pipet Tips Fisher Scientific 02-707-134 1-200uL
LB Agar, Ready-Made Powder Thermo Fisher J75851-A1
Leupeptin Protease Inhibitor Thermo Fisher 78435
Magnesium chloride Thermo Fisher J61014.=E 1M
Magnesium chloride Thermo Fisher J61014.=E 1M
Max Efficiency DH10Bac Competent Cells Gibco 10361012
Microcentrifuge Tubes, 1.7mL VWR 87003-294
Microcentrifuge Tubes, 1.7mL VWR 87003-294
Microcentrifuge Tubes, 1.7mL VWR 87003-294
Microscope Nikon Model: Eclipse Ti with H-TIRF system with 100X TIRF objective
Microscope Camera ORCA-Fusion BT
Microscope Laser Unit Andor iXon Ultra
Miller's LB Broth Corning 46-050-CM
MOPS Millipore Sigma M3183
MOPS Millipore Sigma M3183
NanoDrop One/OneC Microvolume UV-Vis Spectrophotometer Thermo Fisher ND-ONE-W
NanoDrop One/OneC Microvolume UV-Vis Spectrophotometer Thermo Fisher ND-ONE-W
NEB 5-alpha Competent E.coli (High Efficiency) New England Biolabs C2987H
NEBuffer r3.1 New England Biolabs B6003S
NIS Elements Nikon
NIS-Elements Nikon
Nitrocellulose LADD Research Industries 53152
Opti-MEM I Reduced Serum Medium Gibco 31985070
pACEBac1 Vector Geneva Biotech
Parafilm Millipore Sigma P7793
PMSF Millipore Sigma 78830
PureLink RNase A (20 mg/mL) Invitrogen 12091021
QIAprep Spin Miniprep Kit (250) QIAGEN 27106
QIAquick Gel Extraction Kit (50) QIAGEN 28704
QIAquick PCR Purification Kit (50) QIAGEN 28104
Quick CIP New England Biolabs M0525S
Rhodamine phalloidin Invitrogen R415
S.O.C. Medium Invitrogen 15544034
SENP2 protease PMID:17591783 Purified in the lab
Sf9 cells Thermo Fisher 11496015
Sf-900 III SFM (1X) – Serum Free Media Complete Gibco 12658-027
Slide-A-Lyzer G3 Dialysis Cassettes, 10K MWCO, 3 mL Thermo Fisher A52971
Sodium chloride Millipore Sigma S7653
Sodium chloride Millipore Sigma S7653
Stericup Quick Release Vacuum Driven Disposable Filtration System Millipore Sigma S2GPU01RE
Superdex 75 Increase 10/300 GL Cytiva 29148721
T4 DNA Ligase New England Biolabs M0202S
T4 DNA Ligase Buffer – 10X with 10mM ATP New England Biolabs B0202A
Tetracycline Hydrochloride Millipore Sigma T7660-5G
Tris Millipore Sigma 10708976001
Triton X American Bioanalytical 9002-93-1

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Wright, M., Redford, S., Vehar, J., Courtney, K. C., Billington, N., Liu, R. MultiBac System-Based Purification and Biophysical Characterization of Human Myosin-7a. J. Vis. Exp. (210), e67135, doi:10.3791/67135 (2024).

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