Summary

Stable Knockdown of Genes Encoding Extracellular Matrix Proteins in the C2C12 Myoblast Cell Line Using Small-Hairpin (sh)RNA Stable Knockdown of Genes Encoding Extracellular Matrix Proteins in the C2C12 Myoblast Cell Line Using Small-Hairpin (sh))RNA Stable Knockdown of Genes Encoding Extracellular Matrix Proteins in the C2C12 Myoblast Cell Line Using Small-Hairpin (sh)RNA Stable

Published: February 12, 2020
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Summary

Nous fournissons un protocole pour abattre de façon stable les gènes codant les protéines de matrice extracellulaire (ECM) dans les myoblastes C2C12 à l’aide d’ARN à épingle sh. Ciblant ADAMTSL2 à titre d’exemple, nous décrivons les méthodes de validation de l’efficacité de knockdown sur l’ARNm, la protéine et le niveau cellulaire pendant le myoblaste C2C12 à la différenciation myotube.

Abstract

Les protéines de matrice extracellulaire (ECM) sont cruciales pour le développement des muscles squelettiques et l’homéostasie. Le renversement stable des gènes codant pour les protéines ECM dans les myoblastes C2C12 peut être appliqué pour étudier le rôle de ces protéines dans le développement des muscles squelettiques. Ici, nous décrivons un protocole pour épuiser la protéine d’ECM ADAMTSL2 comme exemple, utilisant l’ARN de petite épingle (sh) dans les cellules c2C12. Après transfection des plasmides de shRNA, les cellules stables ont été batch-sélectionnées utilisant la puromycine. Nous décrivons en outre le maintien de ces lignées cellulaires et l’analyse phénotypique par l’expression de l’ARNm, l’expression protéique et la différenciation C2C12. Les avantages de la méthode sont la génération relativement rapide de cellules stables de knockdown c2C12 et la différenciation fiable des cellules c2C12 en myotubes multinucléés lors de l’épuisement du sérum dans le milieu de culture cellulaire. La différenciation des cellules C2C12 peut être surveillée par microscopie lumineuse de champ et en mesurant les niveaux d’expression des gènes canoniques de marqueur, tels que MyoD, myogénine, ou chaîne lourde de myosine (MyHC) indiquant la progression de la différenciation de myoblast c2C12 dans les myotubes. Contrairement à l’élimination transitoire des gènes avec de l’ARN à petite interférence (si), les gènes qui sont exprimés plus tard au cours de la différenciation C2C12 ou pendant la maturation du myotube peuvent être ciblés plus efficacement en générant des cellules C2C12 qui expriment de façon stable shRNA. Les limites de la méthode sont une variabilité dans l’efficacité knockdown, en fonction de l’ARSs spécifique qui peut être surmontée en utilisant des stratégies de knockout gène basé sur CRISPR/Cas9, ainsi que les effets potentiels hors cible de l’ARSs qui devraient être considérés.

Introduction

Les protéines de matrice extracellulaire (ECM) fournissent le soutien structurel pour tous les tissus, la communication de cellules-cellules de médiation, et déterminent le destin de cellules. La formation et le remodelage dynamique de l’ECM sont donc essentiels pour maintenir l’homéostasie des tissus et des organes1,2. Les variantes pathologiques dans plusieurs gènes codant pour des protéines d’ECM donnent lieu à des désordres musculo-squelettiques avec des phénotypes s’étendant des dystrophies musculaires à la construction pseudomouscular3,4. Par exemple, les variantes pathogènes dans ADAMTSL2 causent la dysplasie géléophile extrêmement rare de désordre musculo-squelettique, qui présente avec la construction pseudomusculaire, c.-à-d., une augmentation apparente de la masse de muscle squelettique5. Avec les données d’expression génique chez la souris et l’homme, cela suggère un rôle pour ADAMTSL2 dans le développement des muscles squelettiques ou l’homéostasie6,7.

Le protocole que nous décrivons ici a été développé pour étudier le mécanisme par lequel ADAMTSL2 module le développement de muscle squelettique et/ou l’homéostasie dans un arrangement de culture cellulaire. Nous avons poignardé ADAMTSL2 dans la lignée de myoblastes murine C2C12. Les myoblastes C2C12 et leur différenciation en myotubes est un modèle de culture cellulaire bien décrit et largement utilisé pour la différenciation des muscles squelettiques et la bioingénierie des muscles squelettiques8,9. Les cellules C2C12 passent par des étapes distinctes de différenciation après le retrait de sérum, ayant pour résultat la formation des myotubes multinucleated après 3-10 jours dans la culture. Ces étapes de différenciation peuvent être surveillées de façon fiable en mesurant les niveaux d’ARNm de gènes marqueurs distincts, tels que la myod, la myogénine ou la chaîne lourde de myosine (MyHC). Un avantage de générer des renversements de gènes stables dans les cellules C2C12 est que les gènes qui sont exprimés à des stades ultérieurs de la différenciation C2C12 peuvent être ciblés plus efficacement, par rapport à l’élimination transitoire réalisée par l’ARN à petite interférence (si), qui dure généralement de 5 à 7 jours après la transfection, et est influencé par l’efficacité de la transfection. Un deuxième avantage du protocole tel que décrit ici est la génération relativement rapide de lots de cellules knockdown C2C12 en utilisant la sélection de puromycine. Les solutions de rechange, telles que l’élimination du gène CRISPR/Cas9 ou l’isolement des précurseurs des cellules musculaires squelettiques primaires provenant de souris humaines ou déficientes en gènes cibles, sont techniquement plus difficiles ou nécessitent la disponibilité de biopsies musculaires du patient ou de souris déficientes en gènes cibles, respectivement. Cependant, comme d’autres approches basées sur la culture cellulaire, il ya des limites dans l’utilisation des cellules C2C12 comme modèle pour la différenciation des cellules musculaires squelettiques, tels que la nature bidimensionnelle (2D) de la culture cellulaire mise en place et l’absence de microenvironnement in vivo qui est essentiel pour maintenir indifférenciées cellules précurseurs musculaires squelettiques10.

Protocol

1. Préparation de l’ADN plasmide shRNA d’Escherichia coli Génération de colonies bactériennes clonales porteuses des plasmides shRNA Obtenir des stocks de glycérol d’E. coli transportant des plasmides shRNA spécifiques à la cible et un plasmide de contrôle provenant de sources commerciales (Tableau des matériaux).REMARQUE : Trois plasmides différents de shRNA ont été employés, ciblant différentes régions de l’ARNm Adamtsl2 murine. Un…

Representative Results

La sélection du C2C12 résistant à la puromycine peut être réalisée en 10 à 14 jours après la transfection en raison de l’élimination efficace des cellules non résistantes, c’est-à-dire non transfectées (figure 1B). Typiquement, plus de 80% des cellules se détachent du plat de culture cellulaire et ces cellules sont enlevées pendant l’entretien courant des cellules. Les cellules C2C12 résistantes à la puromycine exprimant l’ARNc de contrôle (brouillé…

Discussion

Nous décrivons ici un protocole pour le knockdown stable des protéines d’ECM dans les myoblastes de C2C12 et pour l’analyse phénotypique de la différenciation des myoblastes de C2C12 dans les myotubes. Plusieurs facteurs déterminent l’issue de l’expérience et doivent être examinés attentivement. Le maintien des cellules C2C12 dans la phase proliférante est une étape critique pour maintenir les cellules C2C12 dans l’état précurseur du myoblaste. Le maintien de la capacité des cellules C2C12 à se di…

Disclosures

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

D.H. est soutenu par les National Institutes of Health (National Institute for Arthritis and Musculoskeletal and Skin Diseases, NIAMS, grant number AR070748) et le fonds de démarrage du Département d’orthopédie Leni et Peter W. May, Icahn School of Medicine à Mont Sinaï.

Materials

Acetone Fisher Chemical 191784
Agar Fisher Bioreagents BP1423
Ampicillin Fisher Bioreagents BP1760-5
Automated cell counter Countesse II Invitrogen A27977
Bradford Reagent Thermo Scientific P4205987
C2C12 cells ATCC CRL-1772
Chamber slides Invitrogen C10283
Chloroform Fisher Chemical 183172
DMEM GIBCO 11965-092
DMSO Fisher Bioreagents BP231-100
DNase I (Amplification Grade) Invitrogen 18068015
Fetal bovine serum VWR 97068-085
GAPDH EMD Millipore MAB374
Glycine VWR Life Sciences 19C2656013
Goat-anti-mouse secondary antibody (IRDYE 800CW) Li-Cor C90130-02
Goat-anti mouse secondary antibody (Rhodamine-red) Jackson Immune Research 133389
HCl Fisher Chemical A144S
Incubator (Shaker) Denville Scientific Corporation 1704N205BC105
Mercaptoethanol Amresco, VWR Life Sciences 2707C122
Midiprep plasmid extraction kit Qiagen 12643
Myosin 4 (myosin heavy chain) Invitrogen 14-6503-82
Mounting medium Invitrogen 2086310
NaCl VWR Life Sciences 241
non-ionic surfactant/detergent VWR Life Sciences 18D1856500
Paraformaldehyde MP 199983
PBS Fisher Bioreagents BP399-4
PEI Polysciences 23966-1
Penicillin/streptomycin antibiotics GIBCO 15140-122
Petridishes Corning 353003
Polypropylene tubes Fisherbrand 149569C
Protease inhibitor cocktail tablets Roche 33576300
Puromycin Fisher Scientific BP2956100
PCR (Real Time) Applied Biosystems 4359284
Reaction tubes Eppendorf 22364111
Reverse Transcription Master Mix Applied Biosystems 4368814
RIPA buffer Thermo Scientific TK274910
sh control plasmid Sigma-Aldrich 07201820MN
sh 3086 plasmid Sigma-Aldrich TRCN0000092578
sh 972 plasmid Sigma-Aldrich TRCN0000092579
sh 1977 plasmid Sigma-Aldrich TRCN0000092582
Spectrophotometer (Nanodrop) Thermo Scientific NanoDrop One C
SYBR Green Reagent Master Mix Applied Biosystems 743566
Trichloroacetic acid Acros Organics 30145369
Trizol reagent Ambion 254707
Trypan blue GIBCO 15250-061
Tryptone Fisher Bioreagents BP1421
Trypsin EDTA 0.25% Gibco-Life Technology Corporation 2085459
Water (DEPC treated and nuclease free) Fisher Bioreagents 186163
Western blotting apparatus Biorad Mini Protean Tetra Cell
Yeast extract Fisher Bioreagents BP1422

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Taye, N., Stanley, S., Hubmacher, D. Stable Knockdown of Genes Encoding Extracellular Matrix Proteins in the C2C12 Myoblast Cell Line Using Small-Hairpin (sh)RNA. J. Vis. Exp. (156), e60824, doi:10.3791/60824 (2020).

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