Summary

Drosophila pupa Retina diseksiyon immünhistokimya, Batı analiz ve RNA izolasyon için

Published: March 15, 2019
doi:

Summary

Bu kağıt doku immünhistokimya, Batı analiz ve RNA-ekstraksiyon için işlenmesi için protokolleri ile birlikte Drosophila pupa retina dissekan için cerrahi bir yöntem sunuyor.

Abstract

Drosophila pupa retina bir mükemmel model sistemi geliştirme sırasında morfogenetik işlemler çalışma için sağlar. Bu yazıda, biz hassas Drosophila pupa retina diseksiyon için güvenilir bir iletişim kuralı mevcut. Bizim cerrahi yaklaşım pupa açmak ve tam olarak ayıklayın göz-beyin kompleksleri için gönüllülük elde edilebilir mikrodiseksiyon araçları kullanır. Bunlar sabit, immünhistokimya ve retina tabi o zaman mikroskop slaytlar monte edilebilir ve hedef hücre veya hücre altı yapıları algılamak için ise görüntüsü. Alternatif olarak, sabitlenmemiş retina olabilir beyin dokusundan izole, uygun arabellekleri lysed ve (protein veya gen ifadesi, sırasıyla değerlendirmek) protein Jel Elektroforez veya mRNA çıkarma için kullanılmaktadır. Önemli uygulama ve sabır açıklanan mikrodiseksiyon Protokolü master için gerekli olabilir, ama hakim sonra protokol çoğunlukla hasarsız retina nispeten hızlı yalıtım sağlar.

Introduction

Drosophila retina pigment hücreleri bir petek kafes1,2,3,4‘ te düzenlenen çevrili yaklaşık 750 ommatidia oluşur. Her ommatidium sekiz photoreceptor nöronlar, dört lens salgılayan koni hücreleri ve iki birincil pigment hücreleri içerir. Her ommatidium çevreleyen pigment üreten kafes hücreleri ve duyusal kıl grupları vardır. Onun sonrası Mitotik doğa ve klişeleşmiş altıgen düzenleme nedeniyle, Drosophila pupa retina morfogenetik süreçleri hücre adezyon5,6de dahil olmak üzere çalışma için bir mükemmel model sistemi sağlar, 7,8,9,10 ve Apoptozis11,12,13,14,15.

Birkaç yayımlanmış protokol hava basıncı Drosophila pupa16,17,18–dan göz-beyin kompleksleri ayıklamak için kullanmak. Açıklanan protokol burada yerine mikrodiseksiyon araçlar için dikkatli bir şekilde kullanır ve tam olarak göz-beyin kompleksleri hasarsız retina doku elde etme amacı ile izole. Bu retina için kullanılmak üzere iseniz çok önemlidir morfolojik, protein veya gen ekspresyonu inceliyor retina hasar hücresel stres veya hücresel fenotip veya gen ifade değişiklik olabilir ölüm neden olabilir beri. Ayrıca, antrenmandan sonra 6-10 göz-beyin kompleksleri 10-15 dk, yaş ve gelişim aşaması disseke göz dokusunun değişkenlik minimize amacı kolaylaştırmak izole.

Fiksasyon, immunostaining ve aşağıda açıklanan bütün Dağı Protokolü floresan mikroskopi Drosophila gözleri hazırlanması için uygundur. Retina protein ilgi hedefleme antikorlar ile inkübe. Örneğin, antikorlar adherens junction bileşenlerine hücrelerinin apikal circumferences böylece hücre türü de dahil olmak üzere özellikleri, şekil ve düzenleme biçilen19olabilir görselleştirmek için yararlı olabilir. Fiksasyon önce gözleri onun yerine–dan Batı analiz için protein veya RNA qRT-PCR kullanımda veya RNA-sıralama çekme amacıyla beyin i ciddi.

Protocol

1. doku hazırlık Drosophila kurmak haçlar (20daha önce açıklandığı gibi) veya istenen genotip pupa elde etmek için belirli Drosophila suşları kültür. Emin olmak için çok sayıda pupa rastlantısal ortaya, bu sinek kültürler içinde yinelenen besin açısından zengin gıda medya veya standart gıda medya cömertçe Maya-yapıştır ile desteklenmiş kurarsınız. 25 ° C’de Drosophila kültürleri korumak UAS-GAL4 sistemi kullanan ha…

Representative Results

Pupa göz gelişimsel süreçleri araştırmak için mükemmel bir model hizmet veren bu sürücü morfogenez kolayca erişilebilir bir dokudur. Burada, retina disseke ve ayirt apikal adherens kavşaklar (şekil 3A, C) veya apoptosis (şekil 3)25sırasında aktif Dcp-1 caspase (şekil 3D) algılamak için kullanılan. Bu yaklaşımlar açıkça işe alım ve morfogenetik Primer hücre (dan 18…

Discussion

Drosophila pupa göz diseksiyon burada açıklanan yöntemi 6-10 göz-beyin kompleksleri 10-15 dakika içinde yalıtım olanak sağlar. Ancak, sabır ve uygulama diseksiyonu tekniği master ve diseksiyonu hızını ve kalitesini geliştirmek için gereklidir. Bu kısa diseksiyon kez her gözün retina bir veri kümesindeki fenotip veya gen ifadesi değişkenliği azaltmak yaklaşık aynı gelişimsel sahne, sağlanır. Alternatif iletişim kuralları daha az pratik master için gerekli olabilir ederken, bizim il…

Disclosures

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

El yazması üzerinde Zack davul ve bizim yorumcular yararlı yorumlar için teşekkür ederiz. Bu eser R15GM114729 tarafından desteklenmiştir.

Materials

Adobe Photoshop Adobe Image processing software
Bamboo splints, 6"  Ted Pella Inc 116
Beta mercaptoethanol Sigma-Aldrich M3148
Beta-glycerol phosphate Sigma-Aldrich 50020
Black dissecting dish Glass petri dish filled to rim with SYLG170 or SYLG184 (colored black with finely ground charcoal powder). Leave at room temperature for 24-48 h to polymerize.
Blade holder Fine Science Tools 10053
Bovine serum albumin Sigma-Aldrich A7906
cOmplete, EDTA-free protease inhibitor cocktail tablets Roche 4693132001
Confocal microscope (Zeiss LSM 501) Carl Zeiss or similar microscope
Diethyl Pyrocarbonate (DEPC) Sigma-Aldrich 40718
Double-sided tape 3M 665
Drosophila food media, nutrient-rich  7.5% sucrose, 15% glucose, 2.5% agar, 20% brewers yeast, 5% peptone, 0.125% MgSO4.7H2O, 0.125% CaCl2.2H20
Drosophila food media, standard Bloomington Drosophila Stock center cornmeal recipe.  (https://bdsc.indiana.edu/information/recipes/bloomfood.html)
Ethylenediaminetetraacetic acid Sigma-Aldrich E6758
Fixative solution 4% formadehyde in PBS, pH 7.4.
Fluorescence microscope (TCS SP5 DM microscope) Leica Microsystems or similar microscope
Forceps  Fine Science Tools 91150-20 Forceps should be sharpened frequently.
Formaldehyde Thermo Scientific 28908
Glass 9-well dishes  Corning 7220-85 Also known as 9-well dishes 
Glass coverslips (22 x 22 mm) Fisher Scientific 12-542-B
Glass microscope slides (25 x 75 x 1 mm) Fisher Scientific 12-550-413
Glass petri dish Corning 3160-100BO
Glycerol Sigma-Aldrich G5516
Image Studio software version 5.2.5 LI-COR Biosciences Image processing software for quantitation of Western blots.
Laemmli sample buffer Bio-Rad 161-0737 2X concentrated protein sample buffer, supplement with beta mercaptoethanol as per manufacturer's instructions.
Lane marker reducing sample buffer  ThermoFisher Scientific 39000 5X concentrated protein sample buffer.
Microcentrigure tubes  Axygen MCT-175-C
Microdissection scissors  Fine Science Tools 15000-03
Microwell trays (72 x 10 µL wells) Nunc 438733
Mounting media 0.5% N-propylgallate and 80% glycerol in PBS
N-propylgallate Sigma-Aldrich P3130
Nuclease-free PBS (PBS in 0.1% DEPC, pH 7.4) Add appropriate volume of DEPC to PBS, mix well and incubate overnight at room temperature with constant stirring. Autoclave for at least 20 minutes. Store at 4°C
PBS (phosphate buffered saline pH 7.4) Sigma-Aldrich P5368 Prepare according to manufacturer's instructions
PBS+pi (PBS plus protease and phoshatase inhibitors) 10mM NaF, 1mM beta-glycerol phosphate and 1mM Na3VO4 in PBS, pH 7.4.  
PBT 0.15% TritonX and 0.5% bovine serum albumin in PBS, pH 7.4
Pin holder Fine Science Tools 26016-12
Primary antibody: goat anti-GAPDH Imgenex IMG-3073 For Western blotting. Used at 1:3000
Primary antibody: rabbit anti-cleaved Dcp-1 Cell signaling 9578S For immunofluorescence. Used at 1:100
Primary antibody: rat anti-DEcad Developmental Studies Hybridoma Bank DCAD2 For immunofluorescence. Used at 1:20
Primary antibody: rat anti-DEcad DOI: 10.1006/dbio.1994.1287 DCAD1  Gift from Tadashi Uemura. Used at 1:100.
RNA extration kit: Relia Prep RNA tissue Miniprep kit  Promega Z6110
Rnase decontamination reagent (RNase Away) Molecular BioProducts 7002
Scalpel blades Fine Science Tools 10050 Break off small piece of scapel blade and secure in blade holder.
Secondary antibody: 488-conjugated  donkey anti-rat IgG (H+L) Jackson ImmunoResearch 712-545-153 For immunofluorescence. Used at 1:200
Secondary antibody: cy3-conjugated goat anti-rabbit IgG (H+L) Jackson ImmunoResearch 111-165-144 For immunofluorescence. Used at 1:100
Secondary antibody: HRP-conjugated goat anti-rat IgG (H+L) Cell Signaling Technology 7077 For Western blotting. Used at 1:3000
Secondary antibody: HRP-conjugated rabbit anti-goat IgG (H+L) Jackson ImmunoResearch 305-035-003 For Western blotting. Used at 1:3000
Sodium Chloride Sigma-Aldrich S3014
Sodium Fluoride Sigma-Aldrich 215309
Sodium vanadate Sigma-Aldrich 50860
Spectrophotometer (NanoDrop) ThermoFisher Scientific 2000c 
Stereo dissecting microscope (M60 or M80) Leica Microsystems or similar microscope
Sylgard (black) Dow Corning SYLG170
Sylgard (transparent) Dow Corning SYLG184 Color black with finely ground charcol powder
Tissue: Kimwipes KIMTECH 34120
TritonX Sigma-Aldrich T8787
Trizma hydrochloride pH7.5 Sigma-Aldrich T5941
Tungsten needle, fine Fine Science Tools 10130-10 Insert into pin holder
Tungsten needle, sturdy Fine Science Tools 10130-20 Insert into pin holder
WTLB (western tissue lysis buffer) 150mM NaCl, 1.5% Triton X-100, 1mM EDTA, 20% glycerol, 10mM NaF, 1mM beta-glycerol phosphate and 1mM Na3VO4 in 50mM Tris-HCl (pH 7.5). Supplement with one cOmplete protease cocktail table per 10 mL solution.
Yeast paste (local supermarket) Approximately 2 tablespoons Fleischmann's ActiveDry Yeast (or similar) dissolved in ~20 mL distilled H2O

References

  1. Cagan, R. L., Ready, D. F. The emergence of order in the Drosophila pupal retina. Developmental biology. 136 (2), 346-362 (1989).
  2. Wolff, T., Ready, D. . The development of Drosophila melanogaster. , 1277-1325 (1993).
  3. Carthew, R. W. Pattern formation in the Drosophila eye. Current opinion in genetics & development. 17 (4), 309-313 (2007).
  4. Kumar, J. P. Building an ommatidium one cell at a time. Developmental Dynamics. 241 (1), 136-149 (2012).
  5. Hayashi, T., Carthew, R. W. Surface mechanics mediate pattern formation in the developing retina. Nature. 431, 647 (2004).
  6. Bao, S., Cagan, R. Preferential Adhesion Mediated by Hibris and Roughest Regulates Morphogenesis and Patterning in the Drosophila Eye. Developmental Cell. 8 (6), 925-935 (2016).
  7. Cordero, J. B., Larson, D. E., Craig, C. R., Hays, R., Cagan, R. Dynamic Decapentaplegic signaling regulates patterning and adhesion in the Drosophila pupal retina. Development (Cambridge, England). 134 (10), 1861-1871 (2007).
  8. Larson, D. E., Liberman, Z., Cagan, R. L. Cellular behavior in the developing Drosophila pupal retina. Mechanisms of development. 125 (3-4), 223-232 (2008).
  9. Martín-Bermudo, M. D., Bardet, P. L., Bellaïche, Y., Malartre, M. The vav oncogene antagonises EGFR signalling and regulates adherens junction dynamics during Drosophila eye development. Development. 142 (8), 1492-1501 (2015).
  10. Chan, E. H., Chavadimane Shivakumar, P., Clément, R., Laugier, E., Lenne, P. F. Patterned cortical tension mediated by N-cadherin controls cell geometric order in the Drosophila eye. eLife. 6, e22796 (2017).
  11. Lin, H. V., Rogulja, A., Cadigan, K. M. Wingless eliminates ommatidia from the edge of the developing eye through activation of apoptosis. Development. 131 (10), 2409-2418 (2004).
  12. Cordero, J., Jassim, O., Bao, S., Cagan, R. A role for wingless in an early pupal cell death event that contributes to patterning the Drosophila eye. Mechanisms of development. 121 (12), 1523-1530 (2004).
  13. Mendes, C. S., et al. Cytochrome c‐d regulates developmental apoptosis in the Drosophila retina. EMBO reports. 7 (9), 933-939 (2006).
  14. Monserrate, J., Brachmann, C. B. Identification of the death zone: a spatially restricted region for programmed cell death that sculpts the fly eye. Cell Death & Differentiation. 14 (2), 209-217 (2007).
  15. Bushnell, H. L., et al. JNK is antagonized to ensure the correct number of interommatidial cells pattern the Drosophila retina. Developmental Biology. 433 (1), 94-107 (2018).
  16. Wolff, T. Dissection techniques for pupal and larval Drosophila eyes. CSH Protoc. 2007, (2007).
  17. Hsiao, H. Y., et al. Dissection and Immunohistochemistry of Larval, Pupal and Adult Drosophila Retinas. Journal of visualized experiments : JoVE. (69), e4347 (2012).
  18. Tea, J. S., Cespedes, A., Dawson, D., Banerjee, U., Call, G. B. Dissection and Mounting of Drosophila Pupal Eye Discs. Journal of Visualized Experiments : JoVE. (93), e52315 (2014).
  19. Johnson, R. I., Cagan, R. L. A Quantitative Method to Analyze Drosophila Pupal Eye Patterning. PLoS ONE. 4 (9), e7008 (2009).
  20. Greenspan, R. J. . Fly pushing : the theory and practice of Drosophila genetics. , (2004).
  21. Brand, A. H., Perrimon, N. Targeted gene expression as a means of altering cell fates and generating dominant phenotypes. Development. 118 (2), 401-415 (1993).
  22. Ellis, M. C., O’Neill, E. M., Rubin, G. M. Expression of Drosophila glass protein and evidence for negative regulation of its activity in non-neuronal cells by another DNA-binding protein. Development. 119 (3), 855-865 (1993).
  23. Duffy, B. J. GAL4 system in drosophila: A fly geneticist’s swiss army knife. genesis. 34 (1-2), 1-15 (2002).
  24. Li, W. Z., Li, S. L., Zheng, H. Y., Zhang, S. P., Xue, L. A broad expression profile of the GMR-GAL4 driver in Drosophila melanogaster. Genet Mol Res. 11 (3), 1997-2002 (2012).
  25. Song, Z., McCall, K., Steller, H. DCP-1, a Drosophila Cell Death Protease Essential for Development. Science. 275 (5299), 536-540 (1997).
  26. Hay, B. A., Wassarman, D. A., Rubin, G. M. Drosophila homologs of baculovirus inhibitor of apoptosis proteins function to block cell death. Cell. 83 (7), 1253-1262 (1995).

Play Video

Cite This Article
DeAngelis, M. W., Johnson, R. I. Dissection of the Drosophila Pupal Retina for Immunohistochemistry, Western Analysis, and RNA Isolation. J. Vis. Exp. (145), e59299, doi:10.3791/59299 (2019).

View Video