La technique présentée ici mesure le chemin de nager librement espèces microscopiques en utilisant l'exposition seule longueur d'onde. C. elegans sont utilisés pour démontrer l'imagerie de l'ombre comme une alternative peu coûteuse à des microscopes coûteux. Cette technique peut être adaptée pour accueillir diverses orientations, milieux et des espèces à mesurer la direction, la vitesse, l'accélération et les forces.
Cette étude montre une technique peu coûteuse et simple qui permet la mesure des propriétés physiques telles que la position, la vitesse, l'accélération et les forces impliquées dans le comportement locomoteur des nématodes en suspension dans une colonne d'eau en réponse à des longueurs d'onde uniques de la lumière. Nous démontrons comment évaluer la locomotion d'un organisme microscopique en utilisant Longueur d'onde unique Ombre Imaging (SWSI) en utilisant deux exemples différents.
Le premier exemple est une étude systématique et statistiquement viable de la descente moyenne de C. elegans dans une colonne d'eau. Pour cette étude, nous avons utilisé de vie et de mort de type sauvage C. elegans. Lorsque nous avons comparé la vitesse et la direction du mouvement actif de nématodes avec la descente passive de vers morts au sein du champ de la gravité, cette étude n'a montré aucune différence en descente fois. La descente moyenne est de 1,5 mm / s ± 0,1 mm / s pour les deux les vers vivants et morts à l'aide de 633 nm cohérentelumière.
Le deuxième exemple est une étude de sélection individuelle C. de cas elegans changement de direction lors de la descente d'une colonne d'eau verticale. L'accélération et la force sont analysés dans cet exemple. Cette étude de cas démontre la portée des autres propriétés physiques qui peuvent être évaluées à l'aide SWSI tout en évaluant le comportement en utilisant des longueurs d'onde unique dans un environnement qui n'est pas accessible avec des microscopes traditionnels. Grâce à cette analyse, nous avons estimé un nématode individu est capable de pousser avec une force de plus de 28 nN.
Nos résultats indiquent que les nématodes vivant exercent 28 nN en tournant, ou se déplaçant contre le champ gravitationnel. Les résultats suggèrent en outre que les nématodes descendent passivement dans une colonne d'eau, mais peuvent activement résister à la force de gravité essentiellement en direction de rotation.
Caenorhabditis elegans est un nématode du sol bénéfique libre-vivant qui est un organisme modèle puissant pour l'étude des mécanismes de régulation des gènes, le développement et, plus récemment, pour la compréhension de la biologie sensorielle et le comportement. Bien qu'ayant seulement 302 neurones, C. elegans sont capables de modèles complexes de locomotion, les comportements en matière de procréation, la navigation, la chimiotaxie et de nombreux autres comportements. C. elegans possèdent des mécanorécepteurs, chémorécepteurs et même détecter des longueurs d'onde de lumière bleue (Ward et al., 2008) 1. Alors que l'on connaît bien les circuits neuronaux de la fonction sensori-motrice et les modèles de locomotion générales C. elegans, on connaît moins les réponses aux multiples stimuli simultanés ou des conditions environnementales plus complexes que ce qui peut être modélisé sous un microscope. Quelques études ont révélé des schémas de locomotion plus complexes qui sont 2,3,4 très plastique. Notre approche méthodologique permettra études de nematodes en solution en temps réel où l'on peut facilement fournir des conditions environnementales multiples simultanément. Cette question est difficile à résoudre en utilisant des techniques d'imagerie conventionnelles basées sur le microscope. Nous avons développé une technique d'imagerie qui permet de placer les nématodes dans une colonne d'eau à examiner les comportements de locomotion, ainsi que de déterminer les capacités de nématodes à changer locomotion en réponse à différentes conditions environnementales.
Longueur d'onde unique Ombre Imaging (SWSI) est présenté dans le présent document pour la première fois à combler les lacunes de microscopes traditionnels. Microscopes classiques sont limités à observer des espèces dans un plan focal horizontal de quelques microns de profondeur 5,6. En ce qui concerne les études de longueur d'onde unique, la plupart des microscopes traditionnels utilisent des filtres de couleurs pour filtrer la lumière blanche très large, généralement, 50-100 nm. L'utilisation d'un laser pour SWSI rétrécit la sélection de longueur d'onde à moins de 1 nm tout en conservant le signeintensité lumineuse ificant 7. De même, les longueurs d'onde simples ont été utilisés pour mesurer les fréquences de natation de C. elegans en temps réel 8.
Pour la première démonstration de notre méthode, nous surveillons la position horizontale, x, et la position verticale, y, d'un C. nager librement elegans dans une colonne d'eau, sur une distance d'environ un centimètre. En particulier, nous sommes intéressés par le mouvement vertical puisque la gravité agit également verticalement. La pente d'un ajustement linéaire à la position verticale donne la vitesse verticale, v y, du nématode à mesure qu'il descend dans la colonne d'eau:
(1)
La moyenne quadratique de l'erreur (RMSE) 9 indique la qualité de l'ajustement et indique si la vitesse de descente est généralement constante. Les vitesses verticales sont alors en moyenne pour eacespèces h et vers morts. Grâce à ces résultats, la traînée, qui l'expérience de vers peut être estimée.
Pour la deuxième manifestation de notre méthode, nous avons sélectionné C. elegans qui ne descendent à une vitesse constante contrairement à la majorité des vers observées. Les vers choisis soit tourné autour et a nagé vers le haut ou plané pendant un moment avant de continuer la descente. Physiquement, cette étude de cas montre que la poussée d'un micro-organisme de natation peut être calculé. Les lois de Newton exigent qu'un corps qui change de direction accélère, ce qui implique une force nette, , Agit sur ce corps 10:
(2)
où estla quantité de mouvement et t est le temps. L'accélération de la vis sans fin est directement proportionnelle à la force agissant sur la vis sans fin car la masse de la vis reste constante. En conséquence, la force nette est verticale:
(3)
où m est la masse d'une vis sans fin et d'un y représente l'accélération verticale. La force nette dans la direction verticale représente alors la poussée de ver dans la même direction. La poussée totale peut être calculé en prenant la composante horizontale en compte.
La technique SWSI fournit un moyen supplémentaire pour comprendre les capacités locomotrices des organismes microscopiques comme les nématodes vivant en liberté. Avec cette technique, nous avons distingué locomotion active (natation) et dérive passive due à la gravité d'exploitation sur les nématodes morts. En outre, lorsque les nématodes nageurs changent de direction lors de la locomotion dans l'eau, nous sommes capables de mesurer les forces de traînée et les forces angulaires, qui opèrent sur les nématodes et exercées par les nématodes.
Nématodes rencontrent des conditions environnementales différentes dans le sol. Il existe de poches d'eau dans le sol, ainsi que des particules solides et des matériaux biologiques de différentes formes et de textures. En outre, les nématodes existent dans un environnement gravitationnel qu'ils répondent à 14. En outre, les nématodes à proximité de la surface du sol sont exposées à différentes longueurs d'onde de lumière, les changements de température et d'humidité, ainsi que biologiquedes variables comme les bactéries, les champignons prédateurs et d'autres organismes du sol. Les nématodes doivent répondre à toutes ces différentes variables, nager et de ramper dans différents médias, en tournant et en modifiant les stratégies de navigation. Tous ces calculs complexes sont réalisés par seulement 302 neurones, un sous-ensemble qui sont impliqués dans la locomotion, et 95 cellules mur musculaires du corps. Les mesures de la sorte décrite par technique SWSI fournissent des informations importantes sur la façon dont les nématodes accomplir cette complexité navigation.
Pour la première partie, nous avons mesuré le taux de descente globale de type sauvage C. elegans à 633 nm lumière. Grâce à ces mesures, nous pouvons estimer la force de traînée un ver rencontres.
Pour l'étude d'un nématode accélération de cas, les forces impliquées changement continue depuis la force de traînée changements avec la vitesse. Il ya certaines déclarations que nous sommes capables de faire sur les forces agissant sur la vis sans fin. Comme le ver ralentit et tente de swim vers le haut la composante verticale de la force de traînée diminue jusqu'à ce qu'elle atteigne zéro au point bas de la trajectoire du nématode. À ce stade, le ver doit avoir une force vers le haut pour remonter.
Cette méthode peut être modifiée de plusieurs manières. Toutes les espèces microscopiques qui navigue dans un liquide clair peuvent être suivis en utilisant SWSI. Les études peuvent être réalisées avec des longueurs d'onde qui sont accessibles aux appareils photo numériques. Les appareils photo numériques seront généralement ramasser des longueurs d'onde allant de l'UV à l'IR proche. En outre, des études peuvent être conduites horizontales en dirigeant le laser verticalement vers le haut. Les espèces peuvent ensuite être placés sur une surface transparente horizontale, comme une lame de microscope. Réglage de l'élargisseur de faisceau ou la loupe après l'élargisseur de faisceau peut aiguiser les images floues. L'utilisateur doit être sûr de fixer tous les composants de la table pour assurer l'alignement du faisceau cohérent et facile.
Le procédé est limité par la disposition wavelengt laserhs et résolution. En substance, les avantages de cette méthode sur des microscopes existants, qui sont la flexibilité dans des directions et des longueurs d'onde, sont aussi des faiblesses car l'installation est simple. L'optique non avertis et taches de laser limitent la résolution. Certains de ces inconvénients peuvent certainement être améliorés à l'avenir, y compris par filtre spatial et projeter l'image directement sur une caméra CCD.
Les étapes les plus critiques dans le protocole peuvent être facilement appris que l'expérience est effectuée pour la première fois. Placer le nématode dans la cuvette sans créer de turbulence est critique. En outre, les vibrations peuvent perturber la configuration et de modifier le comportement des vers. Veillez à limiter le pouvoir, qui est utilisé à l'ombre d'image. 2 mW pour un faisceau laser qui est de 1 mm de diamètre doit être au maximum pour éviter des effets de chauffage. L'installation doit être testé pour la diffusion des effets lors de l'utilisation de liquides autres que l'eau distillée.
Actuellement, la plupart microscopes fonctionnent sur un plan horizontal à l'aide de lumière ou de filtres de couleur blanche, qui sont encore très large dans la gamme de longueur d'onde. Microscopes qui utilisent vraiment longueurs d'onde simples et avoir une flexibilité dans le scénario de visualisation, c'est à dire le positionnement horizontal, sont généralement limités à un avantage ou l'autre. En outre, ces types de microscopes sont généralement très coûteux et toujours limité à la différence des plans focaux notre méthode. Notre installation peut facilement être construit avec un budget extrêmement faible. Cette méthode est prêt à être utilisé par les écoles, les entreprises environnementales ainsi que d'autres entités qui fonctionnent avec peu de financement. Dans l'avenir, cette méthode peut être utilisée dans une configuration très sophistiqué pour étudier les effets en temps réel sur la locomotion et mécanosensibilité d'espèces microscopiques. Ce procédé permet des études de longueur d'onde unique à une large gamme d'angles et profondeurs de visualisation facilement disponibles.
The authors have nothing to disclose.
Nous sommes reconnaissants pour le soutien de l'Institut Vassar College recherche de premier cycle d'été (URSI), le Fonds de recherche sur le saumon Lucy Maynard, prix de la NASA n ° NX09AU90A, Centre National Science Foundation pour l'excellence de la recherche en science et technologie (NSF-CREST), sentence n ° 0630388 et la NSF, sentence n ° 1058385.
Name of Material/ Equipment | Company | Catalog Number | Comments/Description |
Tunable Helium-Neon laser | Research Electro-Optics | 30602 | Four wavelengths can be selected between 543 nm and 633 nm. |
2 Front Surface Aluminum Mirrors | Thorlabs | PF10-03-F01 | |
High Speed Exilim Camera | Casio | ||
Quartz Cuvette | Starna Cells | 21/G/5 | |
LoggerPro (Software) | Vernier | http://www.vernier.com/products/software/lp/ | |
Mathematica 8 | Wolfram | http://www.wolfram.com/ | |
5x – 10x variable zoom Galilean beam expander | Thorlabs | BE05-10-A | |
Plano-convex lens with a positive focal length of 75 mm | Thorlabs | LA1257 |