مرشحات الصوف الزجاجي للفيروسات التي تنتقل عن طريق التركيز ومسببات الأمراض الحيوانية المنشأ الزراعي
Summary
وقد استخدمت المرشحات الصوف الزجاجي للتركيز الفيروسات تنتقل عن طريق المياه من قبل عدد من المجموعات البحثية في مختلف أنحاء العالم. هنا نعرض مقاربة بسيطة لبناء مصافي الصوف الزجاجي وإظهار الفلاتر هي أيضا فعالة في التركيز التي تنقلها المياه الفيروسية، ومسببات الأمراض البكتيرية والأوالي.
Abstract
الخطوة الأساسية الأولى في تقييم مستويات العوامل المسببة للأمراض في المياه الملوثة المشتبه فيها هو تركيز. طرق تركيز تميل الى أن تكون محددة لمجموعة العوامل المسببة للأمراض معينة، على سبيل المثال الولايات المتحدة وكالة حماية البيئة 1623 طريقة لالجيارديات والكريبتوسبوريديوم 1، وهو ما يعني مطلوبة أساليب متعددة إذا كان البرنامج لأخذ العينات وتستهدف أكثر من مجموعة العوامل المسببة للأمراض. عيب آخر من الأساليب المتبعة حاليا هي معدات يمكن ان تكون معقدة ومكلفة، على سبيل المثال طريقة VIRADEL مع فلتر خرطوشة 1MDS لتركيز الفيروسات 2. في هذه المادة ونحن تصف كيفية بناء مصافي الصوف الزجاجي لتركيز مسببات الأمراض التي تنقلها المياه. بعد شطف مرشح، والتركيز هو قابل للتركيز خطوة الثانية، مثل الطرد المركزي، تليها كشف العوامل المسببة للأمراض وتعداد من قبل وسائل ثقافية أو الجزيئي. المرشحات لديها العديد من المزايا. البناء هو سهل ويمكن أن يبنى على المرشحات لنيويورك حجم لتلبية متطلبات محددة لأخذ العينات. الأجزاء مرشح غير مكلفة، مما يجعل من الممكن لجمع عدد كبير من العينات دون التأثير بشدة على ميزانية المشروع. يمكن أن تتركز كميات عينة كبيرة (100S إلى 1000 ق م) وفقا لمعدل انسداد من التعكر عينة. المرشحات هي المحمولة للغاية ومع الحد الأدنى من المعدات، مثل المضخات وتدفق متر، ويمكن تنفيذها في هذا المجال لأخذ العينات النهائية مياه الشرب والمياه السطحية والمياه الجوفية، ومياه الصرف الزراعي. وأخيرا، والزجاج الترشيح صوف فعالة لتركيز مجموعة متنوعة من أنواع الممرض ذلك إلا أسلوب واحد هو ضروري. نحن هنا يقدم تقريرا عن فعالية مرشح في تركيز الفيروس المعوي الإنسان التي تنقلها المياه، S almonella الملهبة، الكريبتوسبوريديوم parvum، وفيروس انفلونزا الطيور.
Protocol
Discussion
وقد استخدمت المرشحات الصوف الزجاجي من قبل فرق بحثية عدة 3،5،6 التركيز الفيروسات المعوية الإنسان من مجموعة متنوعة من مصادر المياه مثل مياه الشرب انتهت 7، 8،9 المياه الجوفية والمياه السطحية 10، مياه البحر 11، مياه الصرف الصحي 12، و جريان الميا?…
Disclosures
The authors have nothing to disclose.
Acknowledgements
ونحن نشكر ويليام ت. إيكرت لروايته الفيديو. وكان تطوير زجاج بروتوكول صوف جزء من المياه ويسكونسن والمحاكمة الصحة للمخاطر المعوية (WAHTER الدراسة)، الذي تموله الولايات المتحدة STAR المنح وكالة حماية البيئة R831630. تم جمع عينات من ألاسكا ريفز A.، رامي ألف، وباء Meixell بدعم مالي من هيئة المسح الجيولوجي الامريكية. أي استخدام الأسماء التجارية، والمنتج، أو شركة لاغراض صفية فقط ولا تعبر عن تأييد حكومة الولايات المتحدة.
Materials
| Name of reagent or item | Company | Catalogue number |
| Hydrochloric acid | Fisher Scientific | A144-500 |
| Sodium hydroxide | Fisher Scientific | BP359-212 |
| Phosphate Buffered Saline Sodium chloride Potassium phosphate-dibasic Potassium phosphate-monobasic |
Fisher Scientific Fisher Scientific Fisher Scientific |
BP358-212 BP363-500 BP362-500 |
| Sodium hypochlorite i.e., household bleach | The Clorox Co. | |
| Sodium thiosulfate, anhydrous | Fisher Scientific | S 475-212 |
| Beef extract, desiccated | Becton, Dickinson and Company | 211520 |
| Glycine | Fisher Scientific | G46-500 |
| Oiled sodocalcic glass wool
Or R-11 unfaced fiberglass insulation |
Isover
Johns Manville |
Bourre 725 QN |
| Polypropylene mesh | Industrial Netting | xN4510 |
| 2″x4″ Sch 80 PVC threaded pipe nipple | Grainger | 6MW35 |
| 2″ Sch 40 PVC cap | Grainger | 5WDW3 |
| Male adapter nylon fitting (1/2″x1/2″) | US Plastic Corp. | 62178 |
| Sample bottles for eluate- 1 liter | Fisher Scientific | 03-313-4F |
| 60 mL syringe | Fisher Scientific | NC9661991 |
| pH strips | Whatman | 2614 991 |
| Prefilter, Polypropylene, 10 inch cartridge, 10 μm | McMaster-Carr | 4411K75 |
| Prefilter housing | Cole-Parmer | S-29820-10 |
References
- US Environmental Protection Agency. Method 1623: Cryptosporidium and Giardia in Water by Filtration/IMS/FA. EPA 815-R-05-002. , (2012).
- Cashdollar, J. L., Dahling, D. R. Evaluation of a method to re-use electropositive cartridge filters for concentrating viruses from tap and river water. J. Virol. Methods. 132, 13-17 (2006).
- Lambertini, E. Concentration of enteroviruses, adenoviruses, and noroviruses from drinking water by use of glass wool filters. Appl. Environ. Microbiol. 74, 2990-2996 (2008).
- Spackman, E. Development of a real-time reverse transcription PCR assay for Type A influenza virus and the avian H5 and H7 hemagglutinin subtypes. J. Clin. Microbiol. 40, 3256-3260 (2002).
- Environment Agency. Optimisation of a new method for detection of viruses in groundwater. Report No. NC/99/40. , (2000).
- Vilaginés, P., Sarrette, B., Husson, G., Vilaginés, R. Glass wool for virus concentration at ambient water pH level. Water Sci. Technol. 27, 299-306 (1993).
- Vivier, J. C., Ehlers, M. M., Grabow, W. O. Detection of enteroviruses in treated drinking water. Water Res. 38, 2699-2705 (2004).
- Powell, K. L., Sililo, O. . Enteric virus detection in groundwater using a glass wool trap. In: Groundwater: Past Achievements and Future Challenges. , 813-816 (2000).
- Hunt, R. J., Borchardt, M. A., Richards, K. D., Spencer, S. K. Assessment of sewer source contamination of drinking water wells using tracers and human enteric viruses. Environ. Sci. Technol. 44, 7956-7963 (2010).
- van Heerden, J., Ehlers, M. M., Heim, A., Grabow, W. O. Prevalence, quantification and typing of adenoviruses detected in river and treated drinking water in South Africa. J. Appl. Microbiol. 99, 234-242 (2005).
- Vilaginés, P. Round robin investigation of glass wool method for poliovirus recovery from drinking water and sea water. Water Sci. Technol. 35, 445-449 (1997).
- Gantzer, C., Senouci, S., Maul, A., Levi, Y., Schwartzbrod, L. Enterovirus genomes in wastewater: concentration on glass wool and glass powder and detection by RT-PCR. J. Virol. Methods. 65, 265-271 (1997).
- Borchardt, M. A., Jokela, W. E., Spencer, S. K. Pathogen losses in surface water runoff from dairy manure applied to corn fields. , (2011).
- Deboosere, N. Development and validation of a concentration method for the detection of influenza A viruses from large volumes of surface water. Appl. Environ. Microbiol. 77, 3802-3808 (2011).
- Lambertini, E. Virus contamination from operation and maintenance practices in small drinking water distribution systems. J. Water Health. 9, 799-812 (2011).
