Quantifying 시냅스 : 시냅스 번호를 수치 Immunocytochemistry 기반 어세이
Summary
이 프로토콜은 dissociated의 연결을 문화와 immunocytochemistry를 사용하여 뇌 부분에서 모두 버렸네 번호를 계량하는 방법 세부 사항. 구획 특정 항체를 사용하여, 우리는 presynaptic 터미널뿐만 아니라 postsynaptic 전문 사이트를 라벨. 우리는이 표시에 의해 생성되는 신호 사이에 colocalization 지점으로 시냅스를 정의합니다.
Abstract
신경 과학의 가장 중요한 목표 중 하나는 버렸네 형성의 초기 단계를 지시 분자 신호를 이해하는 것입니다. 따라서 그것은 시냅스 연결에 변화를 수치 객관적 방법을 개발하기 위해 필수적이되었습니다. 샘플 고정부터,이 프로토콜의 세부 내용은 방법 dissociated의 연결을 문화와 immunocytochemistry를 사용하여 뇌 부분에서 모두 버렸네 번호를 수치. 구획 특정 항체를 사용하여, 우리는 presynaptic 터미널뿐만 아니라 postsynaptic 전문 사이트를 라벨. 우리는이 표시에 의해 생성되는 신호 사이에 colocalization 지점으로 시냅스를 정의합니다. 이 colocalizations의 수는 ImageJ 분석 소프트웨어 플랫폼에 따라 Puncta 분석기 (요청시 가능합니다 바리 워크, c.eroglu @ cellbio.duke.edu 작성한)에 플러그를 사용하여 계량입니다. 이 프로토콜에 설명되어 버렸네 분석은 선택적 사전 및 postsynaptic 마커를 가지고있는 신경 조직이나 문화를 준비 적용할 수 있습니다. 이 버렸네 분석이 널리 시냅스 개발 연구에 활용할 수있는 귀중한 도구입니다.
Protocol
Discussion
위에서 설명한 버렸네 분석은 하나의 문화를 정화 또는 뇌 섹션에서, 우리는 RGCs의 흥분성의 예측에 주로 초점을했었습니다 우리의 실험 목표의 컨텍스트를 기반으로합니다. 우리는 흥분성의 시냅스 (표 1) 라벨을 위해 잘 작동 참조 테이블 목록 항체를 제공하고 있습니다.
이 버렸네 분석은 버렸네의 모든 인구의 연결 번호 또는 선택 사전 및 postsynaptic 마커가있는 다른 신경…
Disclosures
The authors have nothing to disclose.
Acknowledgements
Puncta 분석기 플러그인 J는 배리 워크 (현재 주소 : Physion 컨설팅)에 의해 작성되었습니다 이미지를위한 벤 A. Barres의 연구실에서 (스탠포드 대학).
기금;
- 알프레드 P. 슬로언 재단
- 에스더 A. 요셉 Klingenstein 펀드, 주식 회사
- 광범위한 바이오 메디컬 연구 재단
- 헌팅턴의 질병 이니셔티브에 대한 치료
Materials
| Antigen | Species | Monoclonal/Polyclonal | Vendor | Catalog Number | Dilution | Works in Culture | Works in Sections | |
| Presynaptic | Synapsin | Rabbit | Polyclonal | Synaptic Systems | 106004 | 1:750 | Y | N.D. |
| Synapsin | Mouse | Monoclonal | Synaptic Systems | 106001 | 1:500 | Y | Y | |
| Bassoon | Mouse | Monoclonal | Assay Designs | VAM-PS003F | 1:500 | Y | Y | |
| Bassoon | Guinea Pig | Polyclonal | Synaptic Systems | 141004 | 1:1000 | Y | N.D. | |
| Synaptotagmin 1 | Rabbit | Polyclonal | Synaptic Systems | 105002 | 1:750 | Y | N | |
| Synaptobrevin 2 (C1.69.1) |
Mouse | Monoclonal | Synaptic Systems | 104211 | 1:500 | Y | Y | |
| Synaptophysin (C1.7.2) |
Mouse | Monoclonal | Synaptic Systems | 101011 | 1:500 | Y | Y | |
| VGlut1 | Mouse | Monoclonal | Millipore | MAB5502 | 1:2500 | N | Y | |
| VGlut1 | Guinea pig | Polyclonal | Millipore | AB5905 | 1:2500 | N | Y | |
| VGlut2 | Guinea pig | Polyclonal | Millipore | AB2251 | 1:2500 | N | Y | |
| Postsynaptic | PSD-95 (6G6-1C9 clone) |
Mouse | Monoclonal | Affinity Bio Reagents | MA1-045 | 1:750 | Y | N |
| PSD-95 | Rabbit | Polyclonal | Zymed | 51-6900 | 1:500 | N | Y | |
| Homer | Mouse | Monoclonal | Synaptic Systems | 160011 | 1:500 | Y | N.D. | |
| Homer | Rat | Polyclonal | Millipore | AB5875 | 1:500 | Y | Y | |
| Gephyrin | Rabbit | Polyclonal | Synaptic Systems | 147003 | 1:500 | Y | Y | |
| Gephyrin | Mouse | Monoclonal | Synaptic Systems | 147 | 1:200 | Y | Y |
Table 1: Lists examples of good pre- and postsynaptic markers that we have successfully utilized in our synapse assay. Be aware that this is not an exhaustive list of all available markers. Y = Yes, N = No, N.D. = Not Determined.
| Reagent | Company | Cat. No. |
| PBS | Invitrogen | 20012-027 |
| poly-d-lysine | Sigma | P6407 |
| Laminin | Cultrex | 3400-010-01 |
| Triton X-100 | Roche Diagnostics Gmbh | 9002-93-1 |
| Normal Goat Serum | Gibco | 16210 |
| VectaShield with DAPI | Vector Laboratories | H-1200 |
| OCT | Tissue-Tek | 4583 |
| Tris-Base (50 mM) | Fisher | BP152-5 |
| Bovine Serum Albumin | Sigma | A2153 |
| l-lysine | Sigma | L-1137 |
| 16% PFA solution | Electron Microscopy Sciences | 15711 |
| Granular PFA | Electron Microscopy Sciences | 19210 |
| 24-well culture plate | Falcon | 35-3047 |
| Goat anti-mouse Alexa conjugated antibodies | Invitrogen | — |
| Supply | Company | Cat. No. |
| 12mm, No. 0 glass coverslips | Karl Hecht Gmbh | 1105209 |
| No. 1.5 glass coverslip (for slices) | VWR Scientific | 48393241 |
| Glass slides | VWR Scientific | 48311-703 |
References
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