Journal
/
Bioquímica
/
זרימת עבודה משולבת של זיהוי וכימות במטבולום לא ממוקד מבוסס בקרת FDR
JoVE Journal
Bioquímica
É necessária uma assinatura da JoVE para visualizar este conteúdo.  Faça login ou comece sua avaliação gratuita.
JoVE Journal Bioquímica
An Integrated Workflow of Identification and Quantification on FDR Control-Based Untargeted Metabolome
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

זרימת עבודה משולבת של זיהוי וכימות במטבולום לא ממוקד מבוסס בקרת FDR

DOI:
10.3791/63625-v

•

05:35 min

•

September 20, 2022

•

, , ,
1Key Laboratory of Functional Protein Research of Guangdong Higher Education Institutes and MOE Key Laboratory of Tumor Molecular Biology, Institute of Life and Health Engineering, College of Life Science and Technology,Jinan University, 2Chi-Biotech Co. Ltd.

Capítulos

  • 00:05Introduction
  • 01:07Preparing Metabolomics Datasets
  • 02:21Metabolite Identification and Differential Analysis
  • 03:49Results: Quantitative Analysis by MetaX
  • 04:52Conclusion

Summary

Tadução automática

Tadução automática

בנינו זרימת עבודה מטבולית לא ממוקדת ששילבה את XY-Meta ו-metaX יחד. בפרוטוקול זה, הצגנו כיצד להשתמש ב- XY-Meta כדי ליצור ספרייה ספקטרלית מתוך הפניה לספקטרה בגישה פתוחה, ולאחר מכן ביצענו בקרת FDR והשתמשנו במטה-X כדי להגדיל את המטבוליטים לאחר זיהוי ספקטרום המטבולומיקה.

Tags

FDR ControlUntargeted MetabolomeXY-MetaTarget-decoy StrategyMetabolite IdentificationFalse Positive ReductionBiomarker DiscoveryGNPS DatabaseProteoWizardRaw Data ConversionNIST LibraryXY-Meta ProgramMetaX SoftwareQuantitative AnalysisPCA PlotPeak Annotation

Article

Embed

ADICIONAR À PLAYLIST

Usage Statistics

Vídeos Relacionados

שיטה פשוטה להקרנה כימי תפוקה גבוהה ב Caenorhabditis Elegans

זיהוי של קינאז תלוי-Cyclin 1 אתרי זירחון ספציפיים על-ידי קינאז במבחנה Assay

כימות של היפופיגמנטציה הפעילות במבחנה

קוונפיקציה של קואנזים A בתאים ורקמות

ספקטרוסקופיית ראמאן משולבת ופלטפורמת ספקטרומטר המסה ללימוד תא יחיד קליטת סמים, מטבוליזם, ואפקטים

בדיקות מבוססות-כרומטוגרפיה של נוזלים מבוססי-המסה של טבולומיקס חיטה

זרימת עבודה וכלים להקרנת שברים קריסטלוגרפיים בהלמהולץ-זנטרום ברלין

הערכת ההשפעה של חומרי הדברה על הזחלים של הדבורים הבודדות

כימות של התפלגות גליקוגן תת-תאית בסיבי שריר השלד באמצעות מיקרוסקופיית אלקטרונים שידור

Deciphering Molecular Mechanism of Histone Assembly by DNA Curtain Technique

Read Article