Journal
/
Bioquímica
/
TMT Prøve forberedelse til Proteomics Facility Indsendelse og efterfølgende dataanalyse
JoVE Journal
Bioquímica
This content is Free Access.
JoVE Journal Bioquímica
TMT Sample Preparation for Proteomics Facility Submission and Subsequent Data Analysis

TMT Prøve forberedelse til Proteomics Facility Indsendelse og efterfølgende dataanalyse

DOI:
10.3791/60970-v

•

07:44 min

•

June 08, 2020

•

, , ,
1Department of Pediatrics,University of Florida

Capítulos

  • 00:04Introduction
  • 00:31Protein Extraction
  • 01:40Reducing/Alkylating Reagent Treatment
  • 02:39Methanol/Chloroform Precipitation
  • 04:20Protein Digestion
  • 04:56Peptide Labeling
  • 05:57Results: Representative Protein Quantification and Volcano Plot and Protein Analysis through Evolutionary Relationships (PANTHER) Analyses
  • 07:04Conclusion

Summary

Tadução automática

Tadução automática

Vi præsenterer en optimeret tandem masse tag (TMT) mærkning protokol, der indeholder detaljerede oplysninger for hvert af følgende trin: protein udvinding, kvantificering, nedbør, fordøjelse, mærkning, indsendelse til en proteomics facilitet, og dataanalyser.

Tags

TMT Sample PreparationProteomicsProtein ExtractionLabeling EfficiencyReproducibilityData AcquisitionCHAPS Lysis BufferBead DisruptorSonicationReducing/alkylating Reagent TreatmentTCEPIodoacetamideMethanol/chloroform Precipitation

Article

Embed

ADICIONAR À PLAYLIST

Usage Statistics

Vídeos Relacionados

Lipid Droplet Isolation for Kvantitativ massespektrometri Analyse

Optimal forberedelse af Formalin fast prøver for peptid baseret Matrix Assisted Laser Desorption/Ionisation massespektrometri Imaging arbejdsprocesser

Forberedelse af grønkorn sub rum fra Arabidopsis til analyse af Protein lokalisering af Immunoblotting eller Proteomics

Fuldt autonome karakterisering og indsamling af Data fra krystaller af biologiske makromolekyler

Prøve forberedelse til Sonde Elektrospray Ionization Mass Spektrometri

Analyse af SEC-SAXS-data via EFA-deconvolution og Scatter

En prøveforberedelsespipeline til mikrokrystaller på VMXm Beamline

Forberedelse af højtemperaturprøvegitre til Cryo-EM

Shotgun Proteomics prøvebehandling automatiseret af en open source lab robot

Enkeltpartikel-kryo-EM-dataindsamling med scenehældning ved hjælp af Leginon

Read Article