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Micro-C-XL을 사용한 포유류 3D 게놈 상호 작용 매핑
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JoVE 신문 유전학
Mapping Mammalian 3D Genome Interactions with Micro-C-XL
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Micro-C-XL을 사용한 포유류 3D 게놈 상호 작용 매핑

DOI:
10.3791/64579-v

•

11:41 min

•

November 03, 2023

•

, ,
1Novo Nordisk Foundation Center for Protein Research,University of Copenhagen

Chapters

  • 00:04Introduction
  • 00:26MNase Titration
  • 03:07Preparative MNase Digestion
  • 04:43DNA End Processing and Proximity Ligation
  • 06:50Di‐Nucleosomal DNA Purification and Size Selection
  • 07:42Streptavidin Pull‐Down and On‐Bead Library Preparation
  • 08:59Results: Micro‐C Libraries for Mapping the Mammalian 3D Genome Interactions
  • 11:07Conclusion

Summary

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게놈 전체 염색체 형태 캡처 방법인 Micro-C-XL을 사용하여 뉴클레오솜 분해능으로 3차원 게놈 조직을 매핑하기 위한 프로토콜이 여기에 제시되어 있습니다.

Tags

3D GenomeMicro-C-XLMNase TitrationNucleosome ResolutionChromatin DigestionDNA PurificationAgarose Gel Electrophoresis

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