JoVE 비디오를 활용하시려면 도서관을 통한 기관 구독이 필요합니다. 전체 비디오를 보시려면 로그인하거나 무료 트라이얼을 시작하세요.
High-throughput identificatie van regelgevende gensequenties met behulp van Next-generation Sequencing van circulaire chromosoom conformatie Capture (4C-seq)
Chapters
- 00:04Title
- 00:45Formaldehyde Cross-linking and Cell Lysis
- 01:59First Restriction Digestion and First Ligation
- 05:07Cross-linking Reversion, Chromatin Isolation, and Further Analyses
- 07:42Results: Representative Genomic Track of 4C-seq Read Coverage
- 08:29Conclusion
De identificatie van de fysieke interacties tussen genen en regelgevende elementen is uitdagend maar heeft bevorderd door chromosoom conformatie opname methoden. Deze wijziging van het 4C-seq-protocol PCR bias vermindert door het minimaliseren van de over-amplificatie van PCR sjablonen en maximaliseert de mappability van leest door het opnemen van een toevoeging restrictie-enzym digest stap.
