हम शारीरिक और रोग की स्थिति के तहत लार्वा zebrafish दिमाग से ंयूरॉंस, मैक्रोफेज और microglia को अलग करने के लिए एक प्रोटोकॉल प्रस्तुत करते हैं । अलगाव पर, आरएनए इन कोशिकाओं से निकाला जाता है उनके जीन अभिव्यक्ति प्रोफ़ाइल का विश्लेषण । इस प्रोटोकॉल qPCR और transcriptomics की तरह बहाव विश्लेषण प्रदर्शन के लिए उच्च गुणवत्ता आरएनए के संग्रह के लिए अनुमति देता है ।