JoVE 비디오를 활용하시려면 도서관을 통한 기관 구독이 필요합니다. 전체 비디오를 보시려면 로그인하거나 무료 트라이얼을 시작하세요.
Tvåriktad retroviral integrationsplats PCR-metodik och kvantitativ dataanalys arbetsflöde
1UCLA AIDS Institute,University of California at Los Angeles (UCLA), 2Department of Microbiology, Immunology, & Molecular Genetics,University of California at Los Angeles (UCLA), 3Departments of Biomathematics and Mathematics,University of California at Los Angeles (UCLA), 4Personalized Genomic Medicine Research Center, Division of Strategic Research Groups,Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology, 5Department of Medicine,University of California at Los Angeles (UCLA), 6Department of Veterinary Biosciences, College of Veterinary Medicine,The Ohio State University (OSU)
Chapters
- 00:05Title
- 01:11LTR-specific Biotin-primer Extension
- 02:53Rsal and CviQI Digestion and Blunt-ending
- 04:12Straptavidin Bead Binding
- 05:31Linker Ligation
- 06:39Pre-amplification of Both Left and Right Junction DNA
- 08:15Left- and Right-junction-specific Amplifications
- 10:23Results: The IS Bidirectional Assay Improves Detection Rates and Sequence Quantification Accuracy
- 12:09Conclusion
Detta manuskript beskriver experimentell procedur och mjukvaruanalys för en dubbelriktad integreringsställeanalys som samtidigt kan analysera uppströms och nedströms vektor-värd-kryssnings-DNA. Tvåriktiga PCR-produkter kan användas för någon nedströms sekvenseringsplattform. Den resulterande data är användbar för en hög genomströmning, kvantitativ jämförelse av integrerade DNA-mål.
