بشكل عام،مواقع ربط الليجاند تقع ضمن تجمعات أحماض أمينية محددة أو نطاقات مُخصصة لنوع معين من التفاعل. الأجزاء التي تشكل أهمية حاسمة بالنسبة إلى وظيفة نطاق،مثل ربط الليجاند لم يطرأ أي تغيير عليها أثناء التطور،لأن كقاعدة الطفرات التي تقضي على مهام حيوية قد أُلغيت بالانتقاء الطبيعي. على سبيل المثال،الكثير من البروتينات النووية, بما في ذلك عوامل النسخ تحتوي على نطاقات إف إف التى ترتبط ب آر إن إيه بوليميرلز2.هذه النطاقات تأخذ اسمها من احتواءها على اثنين من الحمضين الأمينين الفينيل ألانين على حلزونين منفصلين. هذا النوع من الحمض الأمينى الفينيل ألانين, إلى جانب القليل من الأحماض امينية الأخرى المحفوظة, تكوّن الجزء المركزى الكاره للماء فى موقع الترابط. إستبدال هذه الأحماض الأمينية سوف يخل بتكوين هذا التركيب المحدد،ومن ثم يؤثر على قدرتها على الربط ب آر إن إيه بوليميراز2 يستخدم العلماء تتبع التطور للعثور على المناطق المحافظة على النطاقات.يتم تنفيذ ذلك بواسطة مقارنة تسلسل الجينوم والبروتين فى النطاقات المماثلة وتحديد الأحماض الأمينية التى بقيت دون تغيير. تحليل لاحق لهذه التسلسلات ذات الصلة تسمح بالتعرف على تجمعات تكونت بواسطة الأحماض الأمينية المحفوظة. يمكن استخدام هذه البيانات في أنشاء نماذج ثلاثية الأبعاد لتحديد أشكال البروتينات،وأيضا التركيب المثالى للتسلسلات الخاصة بهم تحليل التسلسلات المحفوظة والتركيبات تساعد العلماء على فهم العلاقات التطورية بين البروتينات ويسمح لهم أيضاًبتوقع المواقع الرابطة للبروتينات الجديدة المحتواة على تجمعات مماثلة.