Gut Isolation from Zebrafish Larvae for Single-cell RNA Sequencing

Naomi J. M. Kakiailatu; Laura E. Kuil; Eric Bindels; Joke T. M. Zink; Michael Vermeulen; Veerle Melotte; Maria M. Alves

doi:10.3791/65876

Processing Gut Cells from Zebrafish Larvae for Single-Cell RNA Sequencing

November 10, 2023

Aislamiento intestinal de larvas de pez cebra para la secuenciación de ARN de una sola célula

01:24 min

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Obtención de larvas de pez cebra silvestres y transgénicas y disociación de larvas enteras silvestres

01:30 min

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Aislamiento y disociación del intestino de las larvas de pez cebra para el enriquecimiento de células intestinales con FACS

02:37 min

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FACS Enriquecimiento de la suspensión de células intestinales de pez cebra para scRNAseq

01:10 min

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Naomi J. M. Kakiailatu, Laura E. Kuil², Eric Bindels, Joke T. M. Zink, Michael Vermeulen, Veerle Melotte, Maria M. Alves

¹Department of Clinical Genetics,Erasmus University Medical Center – Sophia Children’s Hospital, ²Division of Psychosocial Research and Epidemiology,the Netherlands Cancer Institute, ³Department of Hematology,Erasmus Medical Center, ⁴Department of Pathology, GROW-School for Oncology and Developmental Biology,Maastricht University Medical Center

Summary

Aquí, describimos un método para el aislamiento intestinal de larvas de pez cebra a los 5 días después de la fertilización, para el análisis de secuenciación de ARN de una sola célula.