ジャーナル
/
生化学
/
Untersuchung der RNA-Struktur mit Dimethylsulfat-Mutationsprofilierung mit Sequenzierung in vitro und in Zellen
JoVE Journal
生化学
This content is Free Access.
JoVE Journal 生化学
Probing RNA Structure with Dimethyl Sulfate Mutational Profiling with Sequencing In Vitro and in Cells
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Untersuchung der RNA-Struktur mit Dimethylsulfat-Mutationsprofilierung mit Sequenzierung in vitro und in Zellen

DOI:
10.3791/64820-v

•

10:34 min

•

December 09, 2022

•

,
1Department of Microbiology,Harvard Medical School

章

  • 00:04Introduction
  • 00:36Gene‐Specific In Vitro DMS Modification
  • 02:49Gene‐Specific RT‐PCR of Modified RNA
  • 04:19Whole‐Genome DMS‐MaP Using Virus‐Infected Cells
  • 07:17Analysis of the Sequencing Data
  • 08:12Results: Probing RNA Structure with Dimethyl Sulfate Mutational Profiling and Sequencing
  • 10:00Conclusion

概要

自動翻訳

自動翻訳

Das Protokoll enthält Anweisungen zur Modifizierung von RNA mit Dimethylsulfat für Mutationsprofilierungsexperimente. Es umfasst in vitro und in vivo Sondierung mit zwei alternativen Bibliothekspräparationsmethoden.

タグ

RNA StructureDMS-MaPSequencingIn VitroIn CellsRNA Structure EnsembleBiological ResearchRefolding BufferDimethyl SulfateBeta-mercaptoethanolSpectrophotometerTGIRTComplementary DNAPCR

Article

Embed

プレイリスト追加

Usage Statistics

関連ビデオ

Zeitaufgelöste Elektrospray-Ionisations Wasserstoff-Deuterium-Austausch-Massenspektrometrie zur Struktur Protein Studium und Dynamik

Untersuchung der Proteinsequenz-Struktur-Dynamik Beziehungen zu Bio3D-Web

Polysome Profilerstellung in Leishmaniose, menschliche Zellen und Maus Hoden

Charakterisierung von Glykoproteinen mit dem Immunglobulin-Falz durch Röntgen-Kristallographie und biophysikalischen Techniken

Erforschung der Struktur und Dynamik der Nukleosomen mit Atomic Force Microscopy Imaging

Site-verwiesene Mutagenese für In Vitro und In Vivo Experimente veranschaulicht mit RNA-Interaktionen in Escherichia Coli

Wechselwirkungen mit und Membranpermeabilisierung des Gehirns Mitochondrien durch Amyloid Fibrils

Extrem schnelle und spezifische metabolische Kennzeichnung von RNA In Vivo mit 4-Thiouracil (Ers4tU)

Schnelle und kostengünstige RNA-Extraktion von Ratten-Pankreasgewebe

Phosphoproteomic Strategie zur Profilierung osmotischer Stresssignalisierung bei Arabidopsis

Read Article