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CorExplorer Web ポータルを用した腫瘍遺伝子発現因子の解析
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JoVE Journal がん研究
Analyzing Tumor Gene Expression Factors with the CorExplorer Web Portal
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CorExplorer Web ポータルを用した腫瘍遺伝子発現因子の解析

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08:00 min

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October 11, 2019

DOI:

10.3791/60431-v

DOI:
10.3791/60431-v

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08:00 min
October 11, 2019

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1Lyrid LLC, 2Independent consultant, 3Information Sciences Institute,University of Southern California

概要

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機械学習アルゴリズムCorEx(相関説明)によって見つかった腫瘍RNAシーケンシング因子を探索するためのリソースであるCorExplorerウェブポータルを紹介し、生存に対する因子の分析方法、データベースアニテーション、タンパク質とタンパク質の相互作用、および腫瘍生物学と治療介入に関する洞察を得るために互いに。

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CorExplorerTumor Gene ExpressionInformation MaximizationLatent FactorsCancer BiologyTCGALung CancerRNA SequencingFactor GraphGene ExpressionBiological DiscoveryGene-factor Associations

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Pepke, S., Nelson, W. M., Ver Steeg, G. Analyzing Tumor Gene Expression Factors with the CorExplorer Web Portal. J. Vis. Exp. (152), e60431, doi:10.3791/60431 (2019).

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