This content is Free Access.
Kimyasal Çapraz Bağlama Kütle Spektrometrisi ile Kuaterner Yapı Modellemesi: TX-MS Jupyter Raporlarının Genişletilmesi
1Equipe Signalisation Calcique et Infections Microbiennes,Ecole Normale Supérieure Paris-Saclay, 2Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale, 3Scientific IT Services,ETH Zurich, 4Institute for Computational Science,University of Zurich, 5S3IT,University of Zurich, 6Division of Infection Medicine, Department of Clinical Sciences Lund, Faculty of Medicine,Lund University
章
- 00:04Introduction
- 00:47Targeted Cross-Linking Mass Spectrometry (TX-MS)
- 02:21JupyterHub Installation
- 02:51Report Download
- 03:30Report Extension and Uploading
- 03:50Results: Representative Structural Model of Streptococcus Pyogenes Protein M1 and Human Albumin with XLs Mapped on the Structure
- 04:18Conclusion
Hedeflenen çapraz bağlama kütle spektrometresi, üç farklı edinme protokolü kullanılarak elde edilen kütle spektrometresi verilerini kullanarak kuaterner protein yapı modelleri oluşturur. Cheetah-MS web sunucusunda basitleştirilmiş bir iş akışı olarak yürütüldüğünde, sonuçlar bir Jupyter Not Defterinde raporlanır. Burada, Jupyter Notebook daha derinlemesine bir analiz için nasıl genişletilebileceğinin teknik yönlerini gösteriyoruz.
