This content is Free Access.
Моделирование четвертичной структуры с помощью химической поперечной масс-спектрометрии: расширение отчетов TX-MS Jupyter
1Equipe Signalisation Calcique et Infections Microbiennes,Ecole Normale Supérieure Paris-Saclay, 2Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale, 3Scientific IT Services,ETH Zurich, 4Institute for Computational Science,University of Zurich, 5S3IT,University of Zurich, 6Division of Infection Medicine, Department of Clinical Sciences Lund, Faculty of Medicine,Lund University
章
- 00:04Introduction
- 00:47Targeted Cross-Linking Mass Spectrometry (TX-MS)
- 02:21JupyterHub Installation
- 02:51Report Download
- 03:30Report Extension and Uploading
- 03:50Results: Representative Structural Model of Streptococcus Pyogenes Protein M1 and Human Albumin with XLs Mapped on the Structure
- 04:18Conclusion
Целевая сшивающая масс-спектрометрия создает четвертичные модели структуры белка с использованием данных масс-спектрометрии, полученных с использованием до трех различных протоколов сбора. При выполнении в виде упрощенного рабочего процесса на веб-сервере Cheetah-MS результаты отображаются в записной книжке Jupyter. Здесь мы демонстрируем технические аспекты того, как Jupyter Notebook может быть расширен для более глубокого анализа.
