ジャーナル
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화학 가교 질량 분광법을 통한 사차 구조 모델링: TX-MS Jupyter 보고서 확장
JoVE Journal
生化学
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JoVE Journal 生化学
Quaternary Structure Modeling Through Chemical Cross-Linking Mass Spectrometry: Extending TX-MS Jupyter Reports

화학 가교 질량 분광법을 통한 사차 구조 모델링: TX-MS Jupyter 보고서 확장

DOI:

05:18 min

October 20, 2021

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  • 00:04Introduction
  • 00:47Targeted Cross-Linking Mass Spectrometry (TX-MS)
  • 02:21JupyterHub Installation
  • 02:51Report Download
  • 03:30Report Extension and Uploading
  • 03:50Results: Representative Structural Model of Streptococcus Pyogenes Protein M1 and Human Albumin with XLs Mapped on the Structure
  • 04:18Conclusion

概要

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표적 가교 질량 분광법은 최대 세 가지 다른 수집 프로토콜을 사용하여 획득한 질량 분광법 데이터를 사용하여 사차 단백질 구조 모델을 생성합니다. Cheetah-MS 웹 서버에서 간소화된 워크플로로 실행되면 결과가 Jupyter 노트북에 보고됩니다. 여기서는 Jupyter 노트북을 보다 심층적인 분석을 위해 확장할 수 있는 방법에 대한 기술적 측면을 보여 줍니다.

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