Notre protocole détaillé décrit la création et l’utilisation du modèle avancé d’intestin sur puce, qui simule la muqueuse intestinale humaine avec des structures 3D et divers types de cellules, permettant une analyse approfondie des réponses immunitaires et des fonctions cellulaires en réponse à la colonisation microbienne.
Un modèle avancé d’intestin sur puce recréant des structures épithéliales organotypiques 3D semblables à des villosités et à des cryptes a été développé. Le modèle immunocompétent comprend des cellules endothéliales de la veine ombilicale humaine (HUVEC), des cellules épithéliales intestinales Caco-2, des macrophages résidant dans les tissus et des cellules dendritiques, qui s’auto-organisent au sein du tissu, reflétant les caractéristiques de la muqueuse intestinale humaine. Un aspect unique de cette plateforme est sa capacité à intégrer les cellules immunitaires primaires humaines circulantes, améliorant ainsi la pertinence physiologique. Le modèle est conçu pour étudier la réponse du système immunitaire intestinal à la colonisation et à l’infection bactériennes et fongiques. En raison de la taille de sa cavité élargie, le modèle offre diverses lectures fonctionnelles telles que les tests de perméation, la libération de cytokines et l’infiltration des cellules immunitaires, et est compatible avec la mesure par immunofluorescence des structures 3D formées par la couche de cellules épithéliales. Il fournit ainsi des informations complètes sur la différenciation et la fonction cellulaires. La plateforme d’intestin sur puce a démontré son potentiel dans l’élucidation d’interactions complexes entre les substituts d’un microbiote vivant et le tissu de l’hôte humain au sein d’une plateforme de biopuce perfusée microphysiologique.
Les systèmes d’organes sur puce (OoC) représentent une technique émergente de culture cellulaire 3D capable de combler le fossé entre la culture cellulaire 2D conventionnelle et les modèles animaux. Les plateformes OoC se composent généralement d’un ou plusieurs compartiments contenant des cellules spécifiques aux tissus cultivées sur une large gamme d’échafaudages tels que des membranes ou des hydrogels1. Les modèles sont capables d’imiter une ou plusieurs fonctions organotypiques définies. Les pompes permettent la perfusion microfluidique continue de milieux de culture cellulaire pour l’élimination des déchets cellulaires, l’alimentation en facteurs de nutrition et de croissance pour une meilleure différenciation cellulaire et la recréation de conditions in vivo essentielles. Grâce à l’intégration des cellules immunitaires, les systèmes OoC peuvent imiter la réponse immunitaire humaine in vitro2. À ce jour, un large éventail d’organes et d’unités fonctionnelles ont été présentés1. Ces systèmes comprennent des modèles du système vasculaire3, du poumon4, du foie 2,5 et de l’intestin6 qui peuvent être facilités pour les tests de dépistage de drogues 5,7 et les études d’infection 6,8.
Nous présentons ici un modèle d’intestin humain sur puce intégrant des cellules épithéliales humaines formant une topographie 3D organotypique de structures ressemblant à des villosités et à des cryptes combinées à une muqueuse endothéliale et à des macrophages résidant dans les tissus. Le modèle est cultivé dans une biopuce perfusée de manière microfluidique sous la forme d’une lame microscopique. Chaque biopuce se compose de deux cavités microfluidiques distinctes. Chaque cavité est divisée par une membrane poreuse en polyéthylène téréphtalate (PET) en une chambre supérieure et une chambre inférieure. La membrane elle-même sert également d’échafaudage pour que les cellules se développent de chaque côté. Les pores de la membrane permettent la diaphonie cellulaire et la migration cellulaire entre les couches cellulaires. Chaque chambre est accessible par deux orifices femelles de la taille d’un Luer Lock. En option, un orifice supplémentaire de la taille d’un mini-luer peut permettre d’accéder à la chambre supérieure ou inférieure (Figure 1).
La plate-forme OoC offre un certain nombre de lectures qui peuvent être obtenues à partir d’une seule expérience. L’intestin sur puce est conçu pour combiner la culture cellulaire 3D perfusée, l’analyse des effluents et la microscopie à fluorescence pour évaluer l’expression des marqueurs cellulaires, les taux de métabolisation, la réponse immunitaire, la colonisation et l’infection microbiennes, et la fonction barrière 3,6,8. Le modèle comprend des cellules immunitaires résidentes des tissus et un contact direct de micro-organismes vivants avec le tissu hôte, ce qui est un avantage par rapport aux autres modèles publiés9. De plus, les cellules épithéliales s’auto-organisent en structures tridimensionnelles qui fournissent une interface physiologiquement pertinente pour la colonisation avec un microbiote vivant6.
Le protocole présenté détaille les étapes nécessaires à la génération d’un modèle d’intestin sur puce immunocompétent. Nous avons décrit des techniques spécifiques et des méthodes de lecture possibles telles que la microscopie d’immunofluorescence, l’analyse des cytokines et des métabolites, la cytométrie en flux, l’analyse des protéines et de la génétique, et la mesure de la perméabilité.
Le modèle décrit se compose de HUVEC primaires, de macrophages dérivés …
The authors have nothing to disclose.
Le travail a été soutenu financièrement par le Centre de recherche collaborative PolyTarget 1278 (numéro de projet 316213987) à V.D.W. et A.S.M., A.F. et A.S.M. reconnaissent en outre le soutien financier du pôle d’excellence « Balance of the Microverse » dans le cadre de la stratégie d’excellence de l’Allemagne – EXC 2051 – Project-ID 690 390713860. Nous tenons à remercier Astrid Tannert et le Laboratoire de biophotonique et d’imagerie d’Iéna (JBIL) de nous avoir donné accès à leur microscope confocal à balayage laser ZEISS LSM980. Les figures 1C et 2 ont été créées avec Biorender.com.
96-well plate black, clear bottom | Thermo Fisher | 10000631 | Consumables |
Acetic acid | Roth | 3738.4 | Chemicals |
Alexa Fluor 488 AffiniPure, donkey, anti-mouse IgG (H+L) | Jackson Immuno Research | 715-545-150 | Secondary Antibody Vascular Staining and Epithelial Staining |
Alexa Fluor 647 AffiniPure, donkey, anti-rabbit IgG (H+L) | Jackson Immuno Research | 711-605-152 | Secondary Antibody Epithelial Staining |
Alexa Fluor 647, donkey, anti-rabbit IgG (H+L) | Thermo Fisher Scientific, Invitrogen | A31573 | Secondary Antibody Vascular Staining |
Axiocam ERc5s camera | Zeiss | 426540-9901-000 | Technical equipment |
Basal Medium MV, phenol red-free | Promocell | C-22225 | Cell culture consumables |
Biochip | Dynamic 42 | BC002 | Microfluidic consumables |
BSA fraction V | Gibco | 15260-037 | Cell culture consumables |
C2BBe1 (clone of Caco-2) | ATCC | CRL-2102 | Epithelial Cell Source |
Chloroform | Sigma | C2432 | Chemicals |
CO2 Incubator | Heracell | 150i | Technical equipment |
Collagen IV from human placenta | Sigma-Aldrich | C5533 | Cell culture consumables |
Coverslips (24 x 40 mm; #1.5) | Menzel-Gläser | 15747592 | Consumables |
Cy3 AffiniPure, donkey, anti-goat IgG (H+L) | Jackson Immuno Research | 705-165-147 | Secondary Antibody Vascular Staining |
Cy3 AffiniPure, donkey, anti-rat IgG (H+L) | Jackson Immuno Research | 712-165-150 | Secondary Antibody Epithelial Staining |
DAPI (4',6-Diamidin-2-phenylindol, Dilactate) | Thermo Fisher Scientific, Invitrogen | D3571 | Vascular and Epithelial Staining |
Descosept PUR | Dr.Schuhmacher | 00-323-100 | Cell culture consumables |
DMEM high glucose | Gibco | 41965-062 | Cell culture consumables |
DMEM high glucose w/o phenol red | Gibco | 31053028 | Cell culture consumables |
DPBS (-/-) | Gibco | 14190-169 | Cell culture consumables |
DPBS (+/+) | Gibco | 14040-133 | Cell culture consumables |
EDTA solution | Invitrogen | 15575-038 | Cell culture consumables |
Endothelial Cell Growth Medium | Promocell | C-22020 | Cell culture consumables |
Endothelial Cell Growth Medium supplement mix | Promocell | C-39225 | Cell culture consumables |
Ethanol 96%, undenatured | Nordbrand-Nordhausen | 410 | Chemicals |
Fetal bovine Serum | invitrogen | 10270106 | Cell culture consumables |
Fluorescein isothiocyanate (FITC)-dextran (3-5 kDa) | Sigma Aldrich | FD4-100MG | Chemicals |
Fluorescent Mounting Medium | Dako | S3023 | Chemicals |
Gentamycin (10mg/mL) | Sigma Aldrich | G1272 | Cell culture consumables |
GlutaMAX Supplement (100x) | Gibco | 35050061 | Cell culture consumables |
Histopaque | Sigma-Aldrich | 10771 | Cell culture consumables |
Hoechst (bisBenzimid) H33342 | Sigma-Aldrich | 14533 | Epithelial Staining |
Holotransferrin (5mg/mL) Transferrin, Holo, Human Plasma | Millipore | 616397 | Cell culture consumables |
Human recombinant GM-CSF | Peprotech | 300-30 | Cell culture consumables |
Human recombinant M-CSF | Peprotech | 300-25 | Cell culture consumables |
Illumination device | Zeiss | HXP 120 C | Fluorescence Microscope Setup |
Laser Scanning Microscope | Zeiss | CLSM980 | Fluorescence Microscope Setup |
Lidocain hydrochloride | Sigma-Aldrich | L5647 | Cell culture consumables |
Lipopolysaccharide (LPS) | Sigma | L2630 | Cell culture consumables |
Loftex Wipes | Loftex | 1250115 | Consumables |
Low attachment tubes (PS, 5 mL) | Falcon | 352052 | Consumables |
Luer adapter for the top cap (M) | Mo Bi Tec | M3003 | Microfluidic consumables |
Male mini luer plugs, row of four,PP, opaque | Microfluidic chipshop | 09-0556-0336-09 | Microfluidic consumables |
MEM Non-Essential Amino Acids Solution | Gibco | 11140 | Cell culture consumables |
Methanol | Roth | 8388.2 | Chemicals |
Microscope | Zeiss | Axio Observer 5 | Fluorescence Microscope Setup |
Microscope slides | Menzel | MZ-0002 | Consumables |
Monoclonal, mouse, anti-human CD68 Antibody (KP1) | Thermo Fisher Scientific, Invitrogen | 14-0688-82 | Primary Antibody Vascular Staining |
Monoclonal, rat, anti-human E-Cadherin antibody (DECMA-1) | Sigma-Aldrich, Millipore | MABT26 | Primary Antibody Epithelial Staining |
Multiskan Go plate reader | Thermo Fisher | 51119300 | Technical equipment |
Normal donkey serum | Biozol | LIN-END9010-10 | Chemicals |
Optical Sectioning | Zeiss | ApoTome | Fluorescence Microscope Setup |
Penicillin-Streptomycin (10,000 U/mL) | Gibco | 15140-122 | Cell culture consumables |
Plugs | Cole Parmer | GZ-45555-56 | Microfluidic consumables |
Polyclonal, goat, anti-human VE-Cadherin Antibody | R&D Systems | AF938 | Primary Antibody Vascular Staining |
Polyclonal, rabbit, anti-human Von Willebrand Factor Antibody | Dako | A0082 | Primary Antibody Vascular Staining |
Polyclonal, rabbit, anti-human ZO-1 antibody | Thermo Fisher Scientific, Invitrogen | 61-7300 | Primary Antibody Epithelial Staining |
Power Supply Microscope | Zeiss | Eplax Vp232 | Fluorescence Microscope Setup |
Primovert microscope | Zeiss | 415510-1101-000 | Technical equipment |
Reglo ICC peristaltic pump | Ismatec | ISM4412 | Technical equipment |
SAHA (Vorinostat) | Sigma Aldrich | SML0061-25MG | Chemicals |
Saponin | Fluka | 47036 | Chemicals |
S-Monovette, 7.5 mL Z-Gel | Sarstedt | 01.1602 | Consumables |
S-Monovette, 9.0 mL K3E | Sarstedt | 02.1066.001 | Consumables |
Sodium Pyruvate | Gibco | 11360-088 | Cell culture consumables |
Tank 4.5 mL | ChipShop | 10000079 | Microfluidic consumables |
Trypane blue stain 0.4% | Invitrogen | T10282 | Cell culture consumables |
Trypsin | Gibco | 11538876 | Cell culture consumables |
Tubing | Dynamic 42 | ST001 | Microfluidic consumables |
Tweezers (Präzisionspinzette DUMONT abgewinkelt Inox08, 5/45, 0,06 mm) | Roth | K343.1 | Consumables |
Wheat Germ Agglutinin (WGA) | Thermo Fisher Scientific, Invitrogen | W32464 | Epithelial Staining |
X-VIVO 15 | Lonza | BE02-060F | Cell culture consumables, Hematopoietic cell medium |
Zellkultur Multiwell Platten, 24 Well, sterile | Greiner Bio-One | 662 160 | Consumables |
Zellkultur Multiwell Platten, 6 Well, sterile | Greiner Bio-One | 657 160 | Consumables |
Zen Blue Software | Zeiss | Version 3.7 | Microscopy Software |