概要

דיסוציאציה מכנית ואנזימטית משולבת של רקמת היפוקמפל במוח העכבר

Published: October 21, 2021
doi:

概要

פרוטוקול דיסוציאציה של תאים עצביים זה מיועד לדגימות עם כמות נמוכה של חומר התחלתי ומניב תרחיף חד-תאי בר-קיימא ביותר לניתוח במורד הזרם, עם שלבי קיבוע וצביעה אופציונליים.

Abstract

פרוטוקול דיסוציאציה עצבית זה (התאמה של הפרוטוקול המלווה בערכת דיסוציאציה מסחרית של המוח הבוגר) מייעל את עיבוד הרקמות כהכנה לניתוח מפורט במורד הזרם כגון ציטומטריה של זרימה או ריצוף של תא בודד. דיסוציאציה עצבית יכולה להתבצע באמצעות דיסוציאציה מכנית (כגון שימוש במסננים, טכניקות חיתוך או טריטורציה של פיפטה), עיכול אנזימטי או שילוב שלהם. האופי העדין של תאי העצב יכול לסבך את המאמצים להשיג את ההשעיה החד-תאית האמיתית, בעלת הכדאיות הגבוהה ביותר, עם פסולת תאית מינימלית הנדרשת לניתוח של תאים בודדים. הנתונים מראים כי שילוב זה של דיסוציאציה מכנית אוטומטית ועיכול אנזימטי מניב באופן עקבי תרחיף חד-תאי בר-קיימא ביותר (>90%), תוך התגברות על הקשיים הנ”ל. בעוד שכמה מהשלבים דורשים מיומנות ידנית, שלבים אלה מפחיתים את הטיפול בדגימות ואת אובדן התא הפוטנציאלי. כתב יד זה מפרט כל שלב בתהליך כדי לצייד מעבדות אחרות כדי לנתק בהצלחה כמויות קטנות של רקמות עצביות כהכנה לניתוח במורד הזרם.

Introduction

ההיפוקמפוס תואר לראשונה על ידי אנטומיסט בולונזי, ג’וליו צ’זארה ארנציו, בשנות ה-1500 שלהמאה ה-15. במתן שם למבנה החדש הזה, ארנציו ככל הנראה קיבל השראה מהדמיון המובהק שלו לסוסון הים של הסוג היפוקמפוס1. ההיפוקמפוס מעורב בתגובות עקה אך ידוע בתפקידו בלמידה ובזיכרון. ליתר דיוק, ההיפוקמפוס אחראי על קידוד ואחזור של זיכרון הצהרתי ומרחבי1.

ההיפוקמפוס, או ההיפוקמפוס עצמו, מחולק לתת-שדות CA1 (cornu ammonis), CA2 ו-CA31. בהשוואה לשאר מערכת העצבים, להיפוקמפוס יש מספר מאפיינים מגדירים ייחודיים, כולל הפלסטיות שלו והפוטנציאל לנוירוגנזה מתמשכת2. נוירוגנזה היא תהליך ההתפשטות וההתמיינות של תאי גזע עצביים, ולאחר מכן השתלבותם ברשת העצבית הקיימת. נוירוגנזה מוגבלת לאזור התת-גרנולרי של הג’ירוס המשונן ולאזור התת-חדרי של החדרים הצדדיים (ונורות חוש הריח)3. בעוד שנוירוגנזה נפוצה באמבריוגנזה, זהו תהליך לכל החיים 3,4. ככזה, דיון זה יתמקד בנוירוגנזה של מבוגרים בהיפוקמפוס.

האזורים התת-חדריים והתת-גרנולאריים הם נישות נוירוגניות המכילות תאים אפנדימליים וסקולריים, כמו גם שושלות לא בוגרות ובשלות של תאי גזע עצביים5. מיקרוגליה תורמת לנישות אלה כתאי מערכת החיסון לווסת את הנוירוגנזה6. תאי אב עצביים הם צאצאים של תאי גזע עצבייםשאינם תאי מערכתם של תאי גזע עצביים 7. שלושה סוגים של אבות עצביים נמצאים באזור התת-חדרי: תאים דמויי גליה רדיאליים מסוג B, אבות מגבירי מעבר מסוג C ונוירובלסטים מסוג A 3,8. תאי האב העצביים מסוג B המתחלקים באיטיות באזור התת-חדרי יכולים להתמיין לתאים מסוג C המתחלקים במהירות8. לאחר מכן, תאים מסוג C מתמיינים לתאים מסוג A8. נוירובלסטים אלה נודדים דרך הזרם הנודד הרוסטרלי אל נורת חוש הריח לפני שהם מתמיינים לאינטרנאורונים או לאוליגודנדרוציטים9. פקעות חוש הריח האלה הן המפתח לזיכרון לטווח קצר של חוש הריח, וללמידה אסוציאטיבית, בעוד שהאוליגודנדרוציטים מיאלינטים אקסונים של קורפוס קלוסום9. רוב הנוירוגנזה הבוגרת מתרחשת באזור התת-גרנולרי של הפיתול המשונן, שם נמצאים אבות עצביים רדיאליים מסוג 1 ו-nonradial Type 23. רוב תאי האב העצביים מיועדים להפוך לנוירונים גרגיריים משוננים ואסטרוציטים10. מחוברים על ידי צמתים מרווחים, אסטרוציטים יוצרים רשתות כדי לווסת את הפלסטיות, הפעילות הסינפטית וההתרגשות העצבית5. כנוירון המעורר העיקרי של הפיתול המשונן, תאי גרגירים מספקים קלט מקליפת המוח האנטורינלית לאזור CA311.

ניתן לבודד אוכלוסיות תאי גזע עצביים באמצעות אסטרטגיות בידוד אימונומגנטיות או אימונופלואורסצנטיות12,13. רקמה עצבית קשה במיוחד לניתוק; מאמצים לעשות זאת גורמים לעתים קרובות לדגימות עם כדאיות תאית ירודה ו/או לא מצליחים לייצר את ההשעיה החד-תאית הדרושה לניתוח במורד הזרם. דיסוציאציה עצבית יכולה להתבצע באמצעות דיסוציאציה מכנית (כגון שימוש במסננים, טכניקות חיתוך או טריטורציה של פיפטה), עיכול אנזימטי, או שילוב של טכניקות14,15. במחקר שהעריך שיטות דיסוציאציה עצבית, הכדאיות והאיכות של דיסוציאציה מכנית ידנית על ידי טריטורציה פיפטה לעומת שילובים של טריטורציה פיפטה ועיכול עם אנזימים שונים הושוו15. האיכות דורגה על סמך כמות גושי התאים והדנ”א או הפסולת התת-תאית בתרחיף המוכן15. השעיות של גידולי גליה שהיו נתונים לדיסוציאציה מכנית ידנית בלבד היו בעלות יכולת נמוכה משמעותית של התאים בהשוואה לטיפולים עם דיספוזה או שילוב של DNase, collagenase ו-hyaluronidase15. Volovitz et al. הכירו בשונות הכדאיות והאיכות בין השיטות השונות והדגישו כי דיסוציאציה לא מספקת עלולה להפחית את הדיוק של ניתוח במורד הזרם15.

במחקר נפרד, המחברים השוו יותר מ-60 שיטות ושילובים שונים של דיסוציאציה של תאי עצב בתרבית14. שיטות אלה כללו שמונה וריאציות שונות של דיסוציאציה מכנית ידנית על ידי טריטורציה של פיפטה, השוואה של דגירה עם חמישה אנזימים בודדים בשלושה מרווחי זמן שונים, ושילובים שונים של דיסוציאציה מכנית עם עיכול אנזימטי או שילוב של שני אנזימים14. אף אחת מהשיטות המכניות לא הניבה השעיה חד-תאית14. ארבעה מהטיפולים באנזים יחיד, עשרה מהטיפולים האנזימטיים המשולבים וארבעה מהשילובים של דיסוציאציה מכנית עם עיכול אנזימטי הניבו תרחיף חד-תאי14. עיכול אנזימטי עם TripLE ואחריו Tripsin-EDTA ביעילות היעילה ביותר ניתוק דגימות14. אגב, דגימות שטופלו ב-TrypLE ו/או ב-Trypsin-EDTA נטו ליצור גושים ג’לטיניים14. בעוד שמחקר זה בוצע על תאים בתרבית, הוא מדבר על החסרונות של טריטורציה פיפטה או עיכול אנזימטי בלבד.

חסרות השוואות זו לצד זו של דיסוציאציה מכנית ידנית לעומת אוטומציה. עם זאת, קבוצה אחת הפעילה ציטומטריית זרימה כדי להשוות דיסוציאציה מכנית ידנית ואוטומטית למחצה של מוחות עכברים שלמים בשילוב עם ערכות דיסוציאציה אנזימטיות מסחריות של פפאין או טריפסין16. עיבוד עם הדיסוציאטור הניב באופן עקבי יותר תאים בני קיימא16. בעקבות הדיסוציאציה, החוקרים בודדו גם תאי פרומינין-1, תאים מקדימים עצביים ומיקרוגליה16. עבור שתיים מתוך שלוש אוכלוסיות התאים המבודדים, טוהר התאים המבודדים היה מעט גבוה יותר כאשר הדגימות עובדו עם הדיסוציאטור, בהשוואהל-16 באופן ידני. Reiß et al. ציינו כי השתנות מאדם לאדם בטכניקת הצינורות מעכבת את יכולת השכפול של תפוקת אוכלוסיית התאים בת-קיימא בדיסוציאציה של רקמות16. החוקרים הגיעו למסקנה כי דיסוציאציה מכנית אוטומטית מתקננת עיבוד דגימות16.

שיטת הדיסוציאציה המתוארת בכתב יד זה היא שילוב של דיסוציאציה מכנית אוטומטית לחלוטין ועיכול אנזימטי, תוך שימוש בתמיסות המלוות בערכת דיסוציאציה מסחרית של המוח הבוגר17. בניגוד לפרוטוקולים סטנדרטיים, פרוטוקול מותאם זה מפחית מניפולציה של דגימות, מניב תרחיף חד-תאי בר-קיימא ביותר ומיועד לעיבוד כמויות מינימליות של רקמת התחלה.

Protocol

הניסויים נערכו בהתאם לסטנדרטים האתיים שאושרו על ידי הוועדה המוסדית לטיפול ושימוש בבעלי חיים באוניברסיטת UAMS. נקבה בת 6 חודשים C57Bl6/J של עכברים מסוג בר נרכשו ושוכנו בקבוצות (4 עכברים לכלוב) תחת מחזור קבוע של 12 שעות של אור/חושך. 1. הכנת ריאגנטים הכינו תמיסת מלאי כתמים חיים/מתי…

Representative Results

הדגימות עובדו באמצעות ציטומטר זרימה במתקן ליבה, והנתונים שהתקבלו הוערכו באמצעות חבילת תוכנה לניתוח זרימה. בעבר נותחו בקרות פיצויים – הכתם החי/מת והשליטה השלילית. אם נעשה שימוש במספר פלואורוכרומים, יש להכין בקרות פלואורסצנטיות מינוס אחת (FMO) ובקרות של כתם יחיד עבור כל נוגדן. הפיצוי על החפיפ?…

Discussion

מספר שלבים בפרוטוקול דיסוציאציה עצבית זו דורשים טכניקה מיומנת ומיומנות – פרפוזיה, שאיפה סופרנאטית והסרת מיאלין. לאורך כל תהליך הזלוף, האיברים הפנימיים חייבים להישאר שלמים (מלבד הסרת הסרעפת וגזירת הלב); זה כולל הימנעות מהחדרים העליונים של הלב עם מחט הפרפר. בעוד שכמות המלח עם הפרין הדרושה מ…

開示

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

אנו מודים לאיימי רוג’רס על מתן הדרכה מעשית ותמיכה מתמשכת במוצרים. אנו מודים לד”ר אמנדה בורק על פתרון הבעיות וההבהרה המתמשכים של הדיונים. אנו מודים למרדית יוהיים ולקבוצת התקשורת המדעית של UAMS על העריכה והעיצוב הדקדוקיים של כתב יד זה. מחקר זה נתמך על ידי NIH R25GM083247 ו- NIH 1R01CA258673 (A.R.A).

Materials

1.5 mL Microcentrifuge Tubes Fisher Scientific 02-682-003 Basix, assorted color
15 mL Falcon Tubes Becton Dickinson Labware Europe 352009 Polystyrene
25 mL Serological Pipets Fisher Scientific 14-955-235
5 mL Round Bottom Polystyrene Test Tube Falcon 352052
500 mL Vacuum Filter/ Storage Bottle System Corning 431097
70 μm cell strainer Fisher Scientific 08-771-2
Adult Brain Dissociation Kit Miltenyi Biotec  130-107-677 Contains Enzyme P, Buffer Z, Buffer Y, Enzyme A, Buffer A, Debris Removal Solution
Aluminum Foil Fisher Scientific 01-213-105
Anti-ACSA-2-PE-Vio770, mouse, clone REA969 Miltenyi Biotec 130-116-246
Anti-Myelin Basic Protein Sigma-Aldrich M3821-100UG
Anti-PSA-NCAM-PE, human, mouse and rat, Clone 2-2B Miltenyi Biotec 130-117-394
BD LSRFortessa BD
BSA Sigma-Aldrich A7906-50G
CD11b-VioBlue, mouse, Clone REA592 Miltenyi Biotec 130-113-810
CD31 Antibody Miltenyi Biotec 130-111-541
Ceramic Hot Plate Stirrer Fisher Scientific 11-100-100SH
Dimethyl Sulfoxide Fisher Scientific BP231-100
Ethanol Pharmco by Greenfield Global 111000200
Falcon 50 mL Conical Centrifuge Tubes Fisher Scientific 14-432-22
Fine Scissors – Sharp Fine Science Tools 14060-09 Perfusion
FlowJo BD (v10.7.0)
gentleMACS C Tubes Miltenyi Biotec 130-093-237
gentleMACS Octo Dissociator with Heaters Miltenyi Biotec 130-096-427
Gibco DPBS (1X) ThermoFisher Scientific 14190144
Glass Beaker Fisher Scientific 02-555-25A
Heparin sodium Fresenius Kabi 504011
LIVE/DEAD Fixable Aqua Dead Cell Stain Kit ThermoFisher L34965
Magnetic Stir Bar Fisher Scientific 14-513-51
Noyes Spring Scissors Fine Science Tools 15012-12 Dissection
Paraformaldehyde Sigma-Aldrich 441244-3KG Prilled, 95%
Pipette tips GP LTS 20 µL 960A/10 Rainin 30389270
Pipette Tips GP LTS 250 µL 960A/10 Rainin 30389277
Pipette tips RT LTS 1000 µL FL 768A/8 Rainin 30389213
Rainin Pipet-Lite XLS (2, 20, 200, 1000 μL) Rainin 30386597
RBXMO FITC XADS Fisher Scientific A16167
Round Ice Bucket with Lid Fisher Scientific 07-210-129
Round-Bottom Tubes with Cell Strainer Cap Falcon 100-0087
S1 Pipet Fillers ThermoFisher Scientific 9541
Spatula & Probe Fine Science Tools 10090-13 Dissection & Perfusion
Surflo Winged Infusion Set 23 G x 3/4" Termuno SV-23BLK Butterfly needle
Test Tube Rack Fisher Scientific 14-809-37
Thermo Scientific Legend XTR Centrifuge ThermoFisher discontinued Or other standard table top centrifuge
Variable-Flow Peristaltic Pump Fisher Scientific 13-876-2 Low-flow model
VetFlo Starter Kit for Mice Kent Scientific VetFlo-MSEKIT Anesthesia mask, tubing, induction chamber, charcoal canisters
VetFlo Vaporizer Single Channel Anesthesia System Kent Scientific VetFlo-1210S 0.2–4 LPM
Vi-CELL XR Cell Viability Analyzer Beckman Coulter Life Sciences 731196 Cell Counting
Vi-CELL XR 4 Bags of Sample Vials Beckman Coulter Life Sciences 383721 Cell Counting

参考文献

  1. Andersen, P., Morris, R., Amaral, D., Bliss, T., O’Keefe, J. . The Hippocampus Book. , (2007).
  2. Kempermann, G., Kuhn, H. G., Gage, F. H. Genetic influence on neurogenesis in the dentate gyrus of adult mice. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 94, 10409-10414 (1997).
  3. Zhao, C., Deng, W., Gage, F. H. Mechanisms and Functional Implications of Adult Neurogenesis. Cell. 132, 645-660 (2008).
  4. Kempermann, G., Song, H., Gage, F. H. Neurogenesis in the adult hippocampus. Cold Spring Harbor Perspectives in Biology. 7, 018812 (2015).
  5. Bond, A. M., Ming, G. L., Song, H. Adult mammalian neural stem cells and neurogenesis: Five decades later. Cell Stem Cell. 17, 385-395 (2015).
  6. Sato, K. Effects of microglia on neurogenesis. Glia. 63, 1394-1405 (2015).
  7. Mu, Y., Lee, S. W., Gage, F. H. Signaling in adult neurogenesis. Current Opinion in Neurobiology. 20, 416-423 (2010).
  8. Fares, J., Diab, Z. B., Nabha, S., Fares, Y. Neurogenesis in the adult hippocampus: history, regulation, and prospective roles. International Journal of Neuroscience. 129, 598-611 (2018).
  9. Tosun, M., Semerci, F., Maletic-Savatic, M. Heterogeneity of stem cells in the hippocampus. Advances in Experimental Medicine and Biology. 1169, 31-53 (2019).
  10. Abbott, L. C., Nigussie, F. Adult neurogenesis in the mammalian dentate gyrus. Journal of Veterinary Medicine Series C: Anatomia Histologia Embryologia. 49, 3-16 (2020).
  11. Rodrigues, G. M., Fernandes, T. G., Rodrigues, C. A., Cabral, J. M., Diogo, M. M. Purification of human induced pluripotent stem cell-derived neural precursors using magnetic activated cell sorting. Methods in Molecular Biology. 1283, 137-145 (2015).
  12. Ko, I. K., Kato, K., Iwata, H. Parallel analysis of multiple surface markers expressed on rat neural stem cells using antibody microarrays. Biomaterials. 26, 4882-4891 (2005).
  13. Jager, L. D., et al. Effect of enzymatic and mechanical methods of dissociation on neural progenitor cells derived from induced pluripotent stem cells. Advances in Medical Sciences. 61 (1), 78-84 (2017).
  14. Volovitz, I., et al. A non-aggressive, highly efficient, enzymatic method for dissociation of human brain-tumors and brain-tissues to viable single-cells. BMC Neuroscience. 17, 1-10 (2016).
  15. Adult brain dissociation kit: mouse and rat. Miltenyi Biotec Available from: https://www.miltenyibiotec.com/upload/assets/IM0011920.pdf (2020)
  16. Cell surface flow cytometry staining protocol. Miltenyi Biotec Available from: https://www.miltenyibiotec.com/US-en/applications/all-protocols/cell-surface-flow-cytometry-straining-protocol-pbs-bsa-1-50.html (2021)
  17. Finak, G., Jiang, W., Gottardo, R. CytoML for cross-platform cytometry data sharing. Cytometry Part A: The Journal of the International Society for Analytical Cytology. 93, 1189-1196 (2018).
  18. Turaç, G., et al. Combined flow cytometric analysis of surface and intracellular antigens reveals surface molecule markers of human neuropoiesis. PLoS One. 8, 1-14 (2013).
  19. Schwarz, J. M. Using fluorescence activated cell sorting to examine cell-type-specific gene expression in rat brain tissue. Journal of Visualized Experiments: JoVE. (99), e52537 (2015).
  20. Brummelman, J. application and computational analysis of high-dimensional fluorescent antibody panels for single-cell flow cytometry. Nature Protocols. 14, 1946-1969 (2019).
  21. Recommended controls for flow cytometry. Abcam Available from: https://www.abam.com/protocols/recommended-conntrols-for-flow-cytometry (2021)
  22. . Fixing cells with paraformaldehyde (PFA) for flow cytometry Available from: https://flowcytometry.utoronto.ca/wp-content/uploads/2016/02/FixingCells_PFA.pdf (2021)
  23. Stewart, J. C., Villasmil, M. L., Frampton, M. W. Changes in fluorescence intensity of selected leukocyte surface markers following fixation. Cytometry Part A: The Journal of the International Society for Analytical Cytology. 71, 379-385 (2007).
  24. Armand, E. J., Li, J., Xie, F., Luo, C., Mukamel, E. A. Single-cell sequencing of brain cell transcriptomes and epigenomes. Neuron. 109, 11-26 (2021).
  25. Ho, H., et al. A guide to single-cell transcriptomics in adult rodent brain: The medium spiny neuron transcriptome revisited. Frontiers in Cellular Neuroscience. 12, 1-16 (2018).
  26. Li, L., et al. Novel technologies in studying brain immune response. Oxidative Medicine and Cellular Longevity. 2021, 6694566 (2021).
  27. Liu, H., et al. DNA methylation atlas of the mouse brain at single-cell resolution. bioRxiv. , (2020).
  28. Mattei, D., et al. Enzymatic dissociation induces transcriptional and proteotype bias in brain cell populations. International Journal of Molecular Sciences. 21, 1-20 (2020).
  29. Liu, L., et al. Dissociation of microdissected mouse brain tissue for artifact free single-cell RNA sequencing. STAR Protocols. 2 (2), 100590 (2021).
  30. Delmonte, O. M., Fleisher, T. A. Flow cytometry: Surface markers and beyond. The Journal of Allergy and Clinical Immunology. 143, 528-537 (2019).
  31. O’Connor, J. E., et al. The relevance of flow cytometry for biochemical analysis. IUBMB Life. 51, 231-239 (2001).
  32. Menon, V., Thomas, R., Ghale, A. R., Reinhard, C., Pruszak, J. Flow cytometry protocols for surface and intracellular antigen analyses of neural cell types. Journal of Visualized. Experiments. (94), e52241 (2014).

Play Video

記事を引用
Trujillo, M., McElroy, T., Brown, T., Simmons, P., Ntagwabira, F., Allen, A. R. Combined Mechanical and Enzymatic Dissociation of Mouse Brain Hippocampal Tissue. J. Vis. Exp. (176), e63007, doi:10.3791/63007 (2021).

View Video