Rivista
/
Genetica
/
At udforske Root Microbiome: udtrække bakteriel Fællesskabets Data fra jord, rhizosfære og rod Endosphere
JoVE Journal
Genetica
È necessario avere un abbonamento a JoVE per visualizzare questo.  Accedi o inizia la tua prova gratuita.
JoVE Journal Genetica
Exploring the Root Microbiome: Extracting Bacterial Community Data from the Soil, Rhizosphere, and Root Endosphere

At udforske Root Microbiome: udtrække bakteriel Fællesskabets Data fra jord, rhizosfære og rod Endosphere

24,361 Views

•

09:55 min

•

May 02, 2018

DOI:

10.3791/57561-v

DOI:
10.3791/57561-v

•

09:55 min
May 02, 2018

•

27 Views
, , ,
1Department of Plant and Microbial Biology,University of California, Berkeley, 2Plant Gene Expression Center,USDA ARS

Summary

Automatically generated

Her, beskriver vi en protokol for at opnå amplikon sekvens data af jord, rhizosfære og roden endosphere microbiomes. Denne information kan bruges til at undersøge sammensætningen og mangfoldighed af plante-forbundet mikrobielle samfund, og er velegnet til brug med en bred vifte af plantearter.

Explore More Videos

Root MicrobiomeSoilRhizosphereRoot Endosphere16S Ribosomal RNA GeneCommunity ProfilingMicrobial EcologyDNA ExtractionSequencing LibrarySoil CoreRhizosphere SeparationRoot WashingDNA Extraction

Read Article

Cite this Article

Simmons, T., Caddell, D. F., Deng, S., Coleman-Derr, D. Exploring the Root Microbiome: Extracting Bacterial Community Data from the Soil, Rhizosphere, and Root Endosphere. J. Vis. Exp. (135), e57561, doi:10.3791/57561 (2018).

Download .ris file

Copy

Share Video

.

Copy