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Erzeugung von nativen Chromatin Immunopräzipitation Sequenzierung Bibliotheken für Nukleosom Dichteanalyse
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Generation of Native Chromatin Immunoprecipitation Sequencing Libraries for Nucleosome Density Analysis
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Erzeugung von nativen Chromatin Immunopräzipitation Sequenzierung Bibliotheken für Nukleosom Dichteanalyse

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10:05 min

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December 12, 2017

DOI:

10.3791/56085-v

DOI:
10.3791/56085-v

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10:05 min
December 12, 2017

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1Department of Microbiology and Immunology, Michael Smith Laboratories Centre for High-Throughput Biology,University of British Columbia, 2Canada’s Michael Smith Genome Science Center,BC Cancer Agency

Summary

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Wir präsentieren eine modifizierte native Chromatin Immunopräzipitation Sequenzierung (ChIP-Seq) Methodik für die Generation der Sequenz Datasets geeignet für ein Nukleosom Dichte ChIP-Seq analytischer Rahmen micrococcal Nuklease (MNase) Zugänglichkeit zu integrieren mit Histon Modifikation Messungen.

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Native Chromatin ImmunoprecipitationNucleosome Density AnalysisEpigeneticsEpigenomic FeaturesChromatin SignaturesMNaseCell PreparationLysis BufferMNase DigestionEDTA

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Lorzadeh, A., Lopez Gutierrez, R., Jackson, L., Moksa, M., Hirst, M. Generation of Native Chromatin Immunoprecipitation Sequencing Libraries for Nucleosome Density Analysis. J. Vis. Exp. (130), e56085, doi:10.3791/56085 (2017).

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