Vi presenterar ett praktiskt, steg-för-steg, snabbt protokoll för borttagning av mushjärnor och dissektion av diskreta regioner från färsk hjärnvävnad. Att få hjärnregioner för molekylär analys har blivit rutin i många neurovetenskapliga laboratorier. Dessa hjärnregioner fryses omedelbart för att erhålla transkriptomiska data av hög kvalitet för analys på systemnivå.