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エラー修正 DNA ・ RNA シーケンスを用いた珍しいイベント検出

Journal JoVE
Génétique

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Rare Event Detection Using Error-corrected DNA and RNA Sequencing

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エラー修正 DNA ・ RNA シーケンスを用いた珍しいイベント検出

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10:36 min

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August 03, 2018

DOI:

10.3791/57509-v

DOI:

10.3791/57509-v

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10:36 min

August 03, 2018

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Wing H. Wong*^1,2, R. Spencer Tong*^1,2, Andrew L. Young^1,2, Todd E. Druley^1,2

¹Department of Pediatrics, Division of Hematology and Oncology,Washington University School of Medicine, ²Center for Genome Sciences and Systems Biology,Washington University School of Medicine

Summary

次世代シーケンス (NGS)、プラットフォーム (~0.5–2.0%) の高い誤り率によって制限されるゲノム解析の強力なツールです。NGS のエラーレートを未然に防ぐし、バリアントアレル分 0.0001 のようにまれに突然変異を検出するエラー修正のシーケンスの我々の方法をについて説明します。

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