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Immunologie und Infektion

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在生物安全3级（BSL-3）条件下使胃肠道类器官适应病原体感染和单细胞测序

JoVE Journal
Immunologie und Infektion

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JoVE Journal Immunologie und Infektion

Adapting Gastrointestinal Organoids for Pathogen Infection and Single Cell Sequencing under Biosafety Level 3 (BSL-3) Conditions

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在生物安全3级（BSL-3）条件下使胃肠道类器官适应病原体感染和单细胞测序

DOI:

10.3791/62857-v

•

07:59 min

•

September 10, 2021

•

Megan L. Stanifer², Steeve Boulant^3,4

¹Department of Infectious Diseases, Molecular Virology,Heidelberg University Hospital, ²Department of Molecular Genetics and Microbiology, College of Medicine,University of Florida, Gainesville, ³Department of Infectious Diseases, Virology,Heidelberg University Hospital, ⁴Research Group “Cellular Polarity and Viral Infection”,German Cancer Research Center (DKFZ)

Kapitel

00:04Introduction
01:04Preparation of Single-Cell Solution and Preparation of Gel Beads-in-Emulsion Under Biosafety Level 3 Conditions
05:47Results: Characterization of Host/Pathogen Interactions at a Single-Cell Level Using scRNAseq Technology
07:11Conclusion

Summary

Automatische Übersetzung

该协议描述了如何从根尖或基底外侧感染人肠道类器官，以使用单细胞RNA测序（scRNAseq）技术在单细胞水平上表征宿主/病原体相互作用。

Tags

Keywords: Gastrointestinal Organoids Pathogen Infection Single Cell Sequencing Biosafety Level 3 Viral Infection Intestinal Epithelium Differentiated Organoids Extracellular Matrix Dissociation Enzyme Single Cell RNA Sequencing

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