Journal
/
Biochemie
/
Пробоподготовка для массы на основе спектрометрии идентификации RNA-связывая регионов
JoVE Journal
Biochemie
Zum Anzeigen dieser Inhalte ist ein JoVE-Abonnement erforderlich.  Melden Sie sich an oder starten Sie Ihre kostenlose Testversion.
JoVE Journal Biochemie
Sample Preparation for Mass Spectrometry-based Identification of RNA-binding Regions
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Пробоподготовка для массы на основе спектрометрии идентификации RNA-связывая регионов

DOI:
10.3791/56004-v

•

10:52 min

•

September 28, 2017

•

, , , ,
1Epigenetics Institute,University of Pennsylvania Perelman School of Medicine, 2Department of Cell and Developmental Biology,University of Pennsylvania Perelman School of Medicine, 3Department of Biochemistry and Biophysics,University of Pennsylvania Perelman School of Medicine, 4Graduate Group in Biochemistry and Biophysics,University of Pennsylvania Perelman School of Medicine

Kapitel

  • 00:05Titel
  • 01:04Crosslink of Protein-RNA Interactions in Live Cells
  • 03:26Isolation of Nuclei
  • 04:27Lysis of Nuclei and Trypsin Digestion
  • 05:51Desalting of Peptides
  • 07:39Removal of Crosslinked RNA
  • 08:44Results: RNA-binding Protein and RNA-binding Region Identification
  • 10:04Conclusion

Summary

Automatische Übersetzung

Automatische Übersetzung

Мы описываем протокол для определения RNA-связывая протеинов и сопоставления их RNA-связывая регионов в живых клеток с помощью УФ опосредованной photocrosslinking и масс-спектрометрии.

Tags

Sample PreparationMass SpectrometryRNA-binding ProteinsUV Cross-linking4sU LabelingCell FractionationImmunoprecipitationProtein-RNA InteractionsEpigeneticsCell CultureMouse Embryonic Stem Cells

Article

Embed

ZUR WIEDERGABELISTE HINZUFÜGEN

Usage Statistics

Verwandte Videos

Тандем жидкостной хроматографии на основе подхода для анализа метаболитов<em> Золотистый стафилококк</em

Захват и идентификации RNA-связывая протеинов с помощью щелчка при содействии химия РНК interactome захвата (ЦАРСКОЕ) стратегии

Определение функциональных белков регионов путем строительства химерных белка

НитропептидНое профилирование и идентификация Иллюстрировано Ангиотензином II

Универсальный выборочный держатель для макромолекулярной рентгеновской кристаллографии с минимальным рассеянием фона

Подготовка образца плазмы для масс-спектрометрии с использованием автоматизированной рабочей станции

Образец Подготовки для зонда Электроспрей ионизации масс-спектрометрии

Нецелевая жидкая хроматография-масс-спектрометрия на основе метаболомики Анализ зерна пшеницы

TMT Пример ы подготовки к протеомики объекта представления и последующего анализа данных

Протеомический подход на основе масс-спектрометрии для глобального анализа R-метилирования белка с высокой степенью достоверности

Read Article