Summary

En ny høy gjennomstrømning ex vivo ovine hud sårmodell for testing av nye antibiotika

Published: September 16, 2022
doi:

Summary

Protokollen beskriver en trinnvis metode for å sette opp en ex vivo sau såret hudmodell infisert med Staphylococcus aureus. Denne høykapasitetsmodellen simulerer infeksjoner in vivo bedre sammenlignet med konvensjonelle mikrobiologiteknikker og presenterer forskere med en fysiologisk relevant plattform for å teste effekten av nye antimikrobielle stoffer.

Abstract

Utviklingen av antimikrobielle midler er en kostbar prosess med stadig lavere suksessrate, noe som gjør videre investeringer i antimikrobiell oppdagelsesforskning mindre attraktiv. Antimikrobiell legemiddeloppdagelse og påfølgende kommersialisering kan gjøres mer lukrativ hvis en fail-fast-and-fail-cheap tilnærming kan implementeres innenfor de ledende optimaliseringsstadiene der forskere har større kontroll over stoffdesign og formulering. I denne artikkelen beskrives oppsettet av en ex vivo ovine såret hudmodell infisert med Staphylococcus aureus, som er enkel, kostnadseffektiv, høy gjennomstrømning og reproduserbar. Bakteriefysiologien i modellen etterligner at under infeksjon som bakteriell spredning er avhengig av patogenets evne til å skade vevet. Etableringen av sårinfeksjon verifiseres ved en økning i levedyktige bakterietall sammenlignet med inokulum. Denne modellen kan brukes som en plattform for å teste effekten av nye antimikrobielle stoffer i blyoptimaliseringsstadiet. Det kan hevdes at tilgjengeligheten av denne modellen vil gi forskere som utvikler antimikrobielle stoffer med en fail-fast-and-fail-cheap modell, noe som vil bidra til å øke suksessraten i påfølgende dyreforsøk. Modellen vil også legge til rette for reduksjon og forbedring av dyrebruk for forskning og til slutt muliggjøre raskere og mer kostnadseffektiv oversettelse av nye antimikrobielle stoffer for hud- og bløtvevsinfeksjoner til klinikken.

Introduction

Hudinfeksjoner er et viktig globalt problem, med store økonomiske kostnader for helsepersonell over hele verden. Utvikling av multiresistens og biofilmdannelse av patogener spiller en nøkkelrolle i forekomsten av ikke-helbredende sår 1,2,3,4. Som et resultat av dette er hud- og bløtvevsinfeksjoner en av de vanligste årsakene til utvidet sykehusinnleggelse og påfølgende reinnleggelse5. Forsinkelser i sårheling er kostbare for både pasienten og helsepersonell, med noen estimater som tyder på at rundt 6,5 millioner pasienter påvirkes årlig i USA. I Storbritannia resulterer hudinfeksjoner og tilhørende komplikasjoner i omtrent 75 000 dødsfall årlig 2,4,6.

Staphylococcus aureus (S. aureus) er et formidabelt sårpatogen som ofte isoleres fra pasientsår 2,7. Fremveksten av multiresistens økte drastisk på 2000-tallet. I løpet av denne tiden var rundt 60% av akutte bakterielle hud- og hudstrukturinfeksjoner dyrkningspositive for meticillinresistente S. aureus1. Det økende antallet multiresistente stammer blant stafylokokker, og faktisk andre patogener, i løpet av de siste 2 tiårene indikerer et presserende behov for rask utvikling av antibiotika med nye virkningsmåter som kan overvinne resistens.

Siden begynnelsen av 2000-tallet har imidlertid antibiotikaoppdagelsesprogrammer blitt dominert av lengre utviklingstider og lave suksessrater, med bare 17% av nye antibiotika som går inn i kliniske studier i USA og oppnår markedsgodkjenning8. Dette antyder en forskjell mellom resultater fra in vitro-testing av nye antibiotika og deres kliniske resultater. Det kan hevdes at denne forskjellen i stor grad skyldes forskjeller i bakteriell fysiologi under infeksjoner in vivo og under konvensjonelle mikrobiologiske metoder ved testing av effekten av antibiotika i in vitro prekliniske stadier. Derfor er det behov for nye laboratoriemetoder som er mer representative for bakteriell fysiologi under infeksjon for å forbedre suksessraten i antibiotikaoppdagelsesprogrammer.

Nåværende metoder for å studere hudinfeksjoner inkluderer studier på levende dyr (f.eks. Mus), ex vivo hudmodeller (f.eks. Svin) og 3D-vevskonstruerte hudmodeller (f.eks. Menneske)9,10,11,12. Studier på levende dyr er strengt regulert og har relativt lav gjennomstrømning. I dyremodeller forårsaker sår og infeksjon betydelig nød for dyrene og reiser etiske bekymringer. Menneskelige hudmodeller, ex vivo eller vevskonstruerte, krever etisk godkjenning, overholdelse av lokal og global lovgivning (Human Tissue Act, Helsinkideklarasjonen), og det er vanskelig å skaffe vev, med noen forespørsler som tar år å oppfylle13,14. Begge modelltypene er arbeidsintensive og krever betydelig kompetanse for å sikre eksperimentell suksess. Noen nåværende ex vivo hudinfeksjonsmodeller krever pre-inokulerte plater og tilsetningsstoffer for sårsengen for å muliggjøre infeksjon; Selv om disse modellene er utrolig nyttige, er det begrensninger i infeksjonsprosessen da tilsetningsstoffer begrenser bruken av sårbunnen som næringskilde10,15,16,17. Modellen beskrevet i denne studien bruker ingen tilsetningsstoffer til sårbunnen, noe som sikrer at infeksjonspatologien og levedyktige celletall er et resultat av direkte utnyttelse av sårbunnen som eneste næringskilde.

Gitt behovet for nye laboratoriemetoder, er det utviklet en ny høy gjennomstrømning ex vivo ovine modell av hudinfeksjoner til bruk for å evaluere effekten av nye antibiotika. Hudinfeksjonsstudier står overfor mange utfordringer – høye kostnader, etiske bekymringer og modeller som ikke viser et fullstendig bilde20,21. Ex vivo-modeller og 3D-eksplantasjonsmodeller gir bedre visualisering av sykdomsprosessen, og effekten behandlinger kan ha fra en mer klinisk relevant modell. Her beskrives oppsettet av en ny saueskinnsmodell, som er enkel, reproduserbar og klinisk relevant og har høy gjennomstrømning. Saueskinn ble valgt som sau er et av de store pattedyrene som vanligvis brukes til å modellere responser på infeksjoner in vivo. Dessuten er de lett tilgjengelige fra slakterier, noe som sikrer en jevn tilførsel av hud til forskning, og deres blir ikke skoldet, noe som sikrer god vevskvalitet. Denne studien brukte S. aureus som eksemplarisk patogen; Modellen fungerer imidlertid bra med andre mikroorganismer.

Protocol

Lammehoder fra R.B Elliott og Son Abattoir ble brukt som kilde til hudprøver i dette prosjektet. Alle lammene ble slaktet for konsum som mat. I stedet for å kaste hodene, ble disse gjenbrukt til forskning. Etisk godkjenning var ikke nødvendig da vevet ble hentet fra avfall som ble kastet fra slakterier. 1. Sterilisering Desinfiser tang før oppsamling av hodene ved å ta rene tang og utføre tørr varmesterilisering i en ovn ved 200 °C i 1 time. Autoklav alle gla…

Representative Results

Identifiseringen av en måte å sterilisere huden på før man satte opp sårinfeksjonsmodellen var utfordrende. Utfordringen lå i å sterilisere huden uten å skade de forskjellige hudlagene, som deretter kan få utilsiktede konsekvenser i utfallet av infeksjon. For å identifisere et passende steriliseringsregime ble ulike behandlinger prøvd i varierende tidsperioder, som beskrevet i tabell 1. Forurensning ble registrert som utvikling av turbiditet etter 48 timer i MK-mediet som ble brukt til å oppr…

Discussion

Utviklingen av antimikrobielle midler er et viktig, men dyrt venture som anslås å koste rundt 1 milliard dollar og ta rundt 15 år å fullføre. Over 90% av antimikrobiell legemiddeloppdagelse og prekliniske studier av antimikrobiell legemiddeleffekt utføres av akademiske forskere og små og mellomstore bedrifter med typisk mindre enn 50 ansatte22. Disse lagene er svært økonomisk begrenset, noe som gjør svikt i blymolekyler i senere stadier av translasjonsforskning katastrofal. Økningen i a…

Offenlegungen

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

Forfatterne takker EPSRC (EP/R513313/1) for finansieringen. Forfatterne vil også takke R.B Elliot og Son Abattoir i Calow, Chesterfield, for å gi lammehoder og for å være så imøtekommende i de tidlige stadiene av prosjektet, Kasia Emery for hennes støtte gjennom utviklingen av denne protokollen, og Fiona Wright fra Institutt for infeksjon, immunitet og kardiovaskulær sykdom ved University of Sheffield for å behandle histologiprøvene og være så utrolig nyttig gjennom hele dette prosjektet.

Materials

24 Well Companion Plate SLS  353504
4 mm Biopsy Punch Williams Medical D7484
50 ml centrifuge tubes Fisher Scientific  10788561
8 mm Biopsy Punch Williams Medical D7488
Amphotericin B solution, sterile Sigma  A2942
Colour Pro Style Cordless Hair Clipper Wahl 9639-2117X Hair Clippers
Dual Oven Incubator SLS OVe1020 Sterilising oven
Epidermal growth factor  SLS E5036-200UG
Ethanol Honeywell 458600-2.5L
F12 HAM Sigma N4888
Foetal bovine serum  Labtech International CA-115/500
Forceps Fisher Scientific 15307805
Hair Removal Cream Veet Not applicable
Heracell VIOS 160i Thermo Scientific 15373212  Tissue culture incubator
Heraeus Megafuge 16R VWR 521-2242 Centrifuge
Homogenizer 220, Handheld Fisher Scientific 15575809
Homogenizer 220, plastic blending cones Fisher Scientific  15585819
Insert Individual 24 well 0.4um membrane VWR International 353095
Insulin, recombinant Human SLS 91077C-1G
Medium 199 (MK media) Sigma M0393
Microplate, cell culture Costar 96 well Fisher Scientific 10687551
Multitron Infors Not applicable Bacterial incubator
PBS tablets Sigma  P4417-100TAB
Penicillin-Streptomycin SLS  P0781
Plate seals Fisher Scientific ESI-B-100
Safe 2020 Fisher Scientific 1284804 Class II microbiology safety cabinet
Scalpel blade number 15 Fisher Scientific O305
Scalpel Swann Morton Fisher Scientific 11849002
Sodium bicarbonate Sigma S5761-1KG
Toothed Allis Tissue Forceps Rocialle RSPU500-322
Tryptic Soy Agar Merck Life Science UK Limited 14432-500G-F
Tryptic Soy Broth Merck Life Science UK Limited 41298-500G-F
Vimoba Tablets Quip Labs VMTAB75BX

Referenzen

  1. Claeys, K. C., et al. Novel application of published risk factors for methicillin-resistant S. aureus in acute bacterial skin and skin structure infections. International Journal of Antimicrobial Agents. 51 (1), 43-46 (2018).
  2. Rahim, K., et al. Bacterial contribution in chronicity of wounds. Microbial Ecology. 73 (3), 710-721 (2017).
  3. Guest, J. F., Fuller, G. W., Vowden, P. Costs and outcomes in evaluating management of unhealed surgical wounds in the community in clinical practice in the UK: A cohort study. BMJ Open. 8 (12), 022591 (2018).
  4. Sen, C. K., et al. Human skin wounds: A major and snowballing threat to public health and the economy. Wound Repair and Regeneration. 17 (6), 763-771 (2009).
  5. Wilcox, M. H., Dryden, M. Update on the epidemiology of healthcare-acquired bacterial infections: Focus on complicated skin and skin structure infections. Journal of Antimicrobial Chemotherapy. 76, (2021).
  6. Han, G., Ceilley, R. Chronic wound healing: A review of current management and treatments. Advances in Therapy. 34 (3), 599-610 (2017).
  7. Percival, S. L., Hill, K. E., Malic, S., Thomas, D. W., Williams, D. W. Antimicrobial tolerance and the significance of persister cells in recalcitrant chronic wound biofilms. Wound Repair and Regeneration. 19 (1), 1-9 (2011).
  8. Dheman, N., et al. An analysis of antibacterial drug development trends in the United States, 1980-2019. Clinical Infectious Diseases. 73 (11), 4444-4450 (2021).
  9. MacNeil, S., Shepherd, J., Smith, L. Production of tissue-engineered skin and oral mucosa for clinical and experimental use. Methods in Molecular Biology. 695, 129-153 (2011).
  10. Yang, Q., et al. Development of a novel ex vivo porcine skin explant model for the assessment of mature bacterial biofilms. Wound Repair and Regeneration. 21 (5), 704-714 (2013).
  11. Malachowa, N., Kobayashi, S. D., Lovaglio, J., Deleo, F. R. Mouse model of Staphylococcus aureus skin infection. Methods in Molecular Biology. 1031, 109-116 (2013).
  12. Brandenburg, K. S., Calderon, D. F., Kierski, P. R., Czuprynski, C. J., Mcanulty, J. F. Novel murine model for delayed wound healing using a biological wound dressing with Pseudomonas aeruginosa biofilms. Microbial Pathogenesis. 122, 30-38 (2018).
  13. Bledsoe, M. J., Grizzle, W. E. The use of human tissues for research: What investigators need to know. Alternatives to Laboratory Animals. , (2022).
  14. Danso, M. O., Berkers, T., Mieremet, A., Hausil, F., Bouwstra, J. A. An ex vivo human skin model for studying skin barrier repair. Experimental Dermatology. 24 (1), 48-54 (2015).
  15. Torres, J. P., et al. Ex vivo murine skin model for B. burgdorferi biofilm. Antibiotics. 9 (9), 1-18 (2020).
  16. Zhao, G., et al. Delayed wound healing in diabetic (db/db) mice with Pseudomonas aeruginosa biofilm challenge: A model for the study of chronic wounds. Wound Repair and Regeneration. 18 (5), 467-477 (2010).
  17. Schierle, C. F., Dela Garza, M., Mustoe, T. A., Galiano, R. D. Staphylococcal biofilms impair wound healing by delaying reepithelialization in a murine cutaneous wound model. Wound Repair and Regeneration. 17 (3), 354-359 (2009).
  18. Trøstrup, H., et al. Pseudomonas aeruginosa biofilm aggravates skin inflammatory response in BALB/c mice in a novel chronic wound model. Wound Repair and Regeneration. 21 (2), 292-299 (2013).
  19. Thompson, M. G., et al. Evaluation of gallium citrate formulations against a multidrug-resistant strain of Klebsiella pneumoniae in a murine wound model of infection. Antimicrobial Agents and Chemotherapy. 59 (10), 6484-6493 (2015).
  20. Maboni, G., et al. A novel 3D skin explant model to study anaerobic bacterial infection. Frontiers in Cellular and Infection Microbiology. 7, 404 (2017).
  21. Macneil, S. Progress and opportunities for tissue-engineered skin. Nature. 445 (7130), 874-880 (2007).
  22. Theuretzbacher, U., Outterson, K., Engel, A., Karlén, A. The global preclinical antibacterial pipeline. Nature Reviews Microbiology. 18 (5), 275-285 (2019).
  23. Miethke, M., et al. Towards the sustainable discovery and development of new antibiotics. Nature Reviews Chemistry. 5 (10), 726-749 (2021).
  24. Guedes, G. M. M., et al. Ex situ model of biofilm-associated wounds: Providing a host-like environment for the study of Staphylococcus aureus and Pseudomonas aeruginosa biofilms. Journal of Applied Microbiology. 131 (3), 1487-1497 (2021).
  25. Johnson, C. J., et al. Augmenting the activity of chlorhexidine for decolonization of Candida auris from porcine skin. Journal of Fungi. 7 (10), 804 (2021).
  26. Horton, M. V., et al. Candida auris Forms High-Burden Biofilms in Skin Niche Conditions and on Porcine Skin. mSphere. 5 (1), 00910-00919 (2020).
  27. Ashrafi, M., et al. Validation of biofilm formation on human skin wound models and demonstration of clinically translatable bacteria-specific volatile signatures. Scientific Reports. 8, 1-16 (2018).
  28. Brackman, G., Coenye, T. In vitro and in vivo biofilm wound models and their application. Advances in Experimental Medicine and Biology. 897, 15-32 (2016).
  29. Rumbaugh, K. P., Carty, N. L. In Vivo Models of Biofilm Infection. Biofilm Infections. , 267-290 (2011).
  30. Boase, S., Valentine, R., Singhal, D., Tan, L. W., Wormald, P. J. A sheep model to investigate the role of fungal biofilms in sinusitis: Fungal and bacterial synergy. International Forum of Allergy & Rhinology. 1 (5), 340-347 (2011).
  31. Williams, D. L., et al. Experimental model of biofilm implant-related osteomyelitis to test combination biomaterials using biofilms as initial inocula. Journal of Biomedical Materials Research. Part A. 100 (7), 1888-1900 (2012).
  32. Scheerlinck, J. P. Y., Snibson, K. J., Bowles, V. M., Sutton, P. Biomedical applications of sheep models: From asthma to vaccines. Trends in Biotechnology. 26 (5), 259-266 (2008).
  33. Metcalfe, A. D., Ferguson, M. W. J. Tissue engineering of replacement skin: The crossroads of biomaterials, wound healing, embryonic development, stem cells and regeneration. Journal of the Royal Society Interface. 4 (14), 413-417 (2007).
  34. Kazemi-Darabadi, S., Sarrafzadeh-Rezaei, F., Farshid, A. A., Dalir-Naghadeh, B. Allogenous skin fibroblast transplantation enhances excisional wound healing following alloxan diabetes in sheep, a randomized controlled trial. International Journal of Surgery. 12 (8), 751-756 (2014).
  35. Martinello, T., et al. Allogeneic mesenchymal stem cells improve the wound healing process of sheep skin. BMC Veterinary Research. 14 (1), 1-9 (2018).
  36. Roberts, C. D., Windsor, P. A. Innovative pain management solutions in animals may provide improved wound pain reduction during debridement in humans: An opinion informed by veterinary literature. International Wound Journal. 16 (4), 968 (2019).
  37. Mazzone, L., et al. Bioengineering and in utero transplantation of fetal skin in the sheep model: A crucial step towards clinical application in human fetal spina bifida repair. Journal of Tissue Engineering and Regenerative Medicine. 14 (1), 58-65 (2020).
  38. Olkowska, E., Gržinić, G. Skin models for dermal exposure assessment of phthalates. Chemosphere. 295, 133909 (2022).
  39. Couto, N., et al. Label-free quantitative proteomics and substrate-based mass spectrometry imaging of xenobiotic metabolizing enzymes in ex vivo human skin and a human living skin equivalent model. Drug Metabolism and Disposition. 49 (1), 39-52 (2021).

Play Video

Diesen Artikel zitieren
Regan, H. C., Taylor, A. F., Karunakaran, E. A Novel High-Throughput Ex Vivo Ovine Skin Wound Model for Testing Emerging Antibiotics. J. Vis. Exp. (187), e64041, doi:10.3791/64041 (2022).

View Video