Back to chapter

12.9:

Epistase

JoVE Core
Biologie
Zum Anzeigen dieser Inhalte ist ein JoVE-Abonnement erforderlich.  Melden Sie sich an oder starten Sie Ihre kostenlose Testversion.
JoVE Core Biologie
Epistasis

Sprachen

Teilen

– [Verteller] Naast meerdere allelen, kunnen verschillende genen op verschillende locaties op elkaar inwerken en invloed uitoefenen op fenotypen zoals bontpigmenten in een fenomeen dat epistase wordt genoemd. Bijvoorbeeld, de kleur van een konijn wordt beïnvloed door verschillende genen, waaronder tyrosinase. Opvallend is dat ongepigmenteerde dieren die er volledig wit uitzien, homozygoot zijn voor een recessief gemuteerd allel van tyrosinase, terwijl de dieren die het dominante allel dragen, een gekleurde vacht hebben. Een dergelijke kleur wordt gedeeltelijk vastgesteld door een ander gen genaamd tyrosinase-gerelateerd eiwit 1, dat wordt afgekort tot TYRP1. De dominante variant veroorzaakt hier zwarte vacht, terwijl het recessieve allel een bruine of chocoladetint veroorzaakt. Afgezien van andere factoren die betrokken zijn bij de vachtkleur, zijn konijnen die heterozygoot zijn op deze twee loci, zwart van kleur. En wanneer ze paren, zal elke nakomeling met twee recessieve tyrosinase allelen een witte, ongepigmenteerde vacht hebben, ongeacht hun TYRP1-elementen, aangezien de recessieve allelen van tyrosinase de bruine of zwarte kleur van de vacht maskeren of verbergen, die anders geproduceerd zou zijn. Dit is een voorbeeld van recessieve epistase, waarbij de tyrosinaseconfiguratie epistatisch is ten opzichte van TYRP1. Door epistatische interacties te evalueren, kunnen onderzoekers begrijpen hoe verschillende soorten vachtkleuren ontwikkelden voor unieke omgevingen, en kunnen ze zelfs bepalen of genen zich binnen dezelfde cellulaire weg gedragen.

12.9:

Epistase

Niet alleen meerdere allelen op dezelfde locus kunnen eigenschappen beïnvloeden, maar ook talrijke genen of allelen op verschillende locis kunnen interageren en het fenotypen beïnvloeden, wat ook wel epistase genoemd wordt. Konijnenbont kan bijvoorbeeld zwart of bruin zijn, afhankelijk van of het dier homozygoot dominant of heterozygoot is op een TYRP1- locus. Als het konijn echter ook homozygoot recessief is op een locus op het tyrosinase-gen ( TYR ), zal het een niet-gearceerde vacht hebben die wit lijkt, ongeacht de TYRP1- allelen. Dit is een voorbeeld van recessieve epistase en toont aan dat de meeste biologische systemen veel genetische elementen bevatten die op meerdere en complexe manieren op elkaar inwerken.

Epistase

Hoewel Mendel zeven niet-verwante eigenschappen in erwten koos om gensegregatie te bestuderen, omvatten de meeste eigenschappen meerdere geninteracties die een spectrum van fenotypes creëren. Wanneer de interactie van verschillende genen of allelen op verschillende locaties een fenotype beïnvloedt, wordt dit epistase genoemd. Epistase houdt vaak in dat het ene gen de expressie van een ander maskeert of verstoort (antagonistische epistase). Epistase treedt vaak op wanneer verschillende genen deel uitmaken van dezelfde biochemische route. De expressie van een gen kan afhangen van een genproduct in dezelfde biochemische route.

Tyrosinase en TYRP1

Een voorbeeld van epistase is vachtpigmentatie bij konijnen. Veel genen hebben invloed op de vachtkleur van een konijn, waaronder een die tyrosinase ( TYR ) wordt genoemd. Dieren die homozygoot dominant of heterozygoot zijn op een tyrosinase-locus, zullen gekleurde vachten produceren, terwijl homozygote recessieve konijnen ongepigmenteerde vachten ontwikkelen die wit lijken. De vachtkleur wordt ook gedeeltelijk vastgesteld door een ander gen genaamd tyrosinase-gerelateerd proteïne 1 ofwel TYRP1 . Het dominante allel produceert een zwarte vacht en het recessieve allel produceert een bruine of chocoladebont.

Ongeacht andere factoren die een rol spelen bij de vachtkleur, zullen konijnen die heterozygoot zijn op beide loci een zwarte vacht hebben. Hun nakomelingen erven twee recessieve tyrosinase-allelen en zullen een witte, ongepigmenteerde vacht hebben, ongeacht welke TYRP1- allelen ze erven. Dit is een voorbeeld van recessieve epistase omdat de recessieve TYR- allelen de productie van een zwarte of bruine vacht maskeren of verstoren. In dit geval is TYR epistatisch aan TYRP1 .

De complexiteit van genetische interacties

De studie van epistatische interacties stelt onderzoekers in staat te begrijpen hoe verschillende diersoorten een vachtkleur ontwikkelde die bij de unieke leefomgevingen pasten. Het bestuderen van epistatische interacties helpt het bij het bepalen van de functionele relatie tussen genen, de volgorde van genen in een biochemische route en hoe verschillende allelen kwantitatief van invloed zijn op fenotypes. De introductie van het concept epistase heeft duidelijk gemaakt dat dat de meeste biologische systemen veel genetische elementen bevatten die op meerdere en complexe manieren met elkaar in wisselwerking staan.

Suggested Reading

Polster, Robert, Christos J. Petropoulos, Sebastian Bonhoeffer, and Frédéric Guillaume. “Epistasis and Pleiotropy Affect the Modularity of the Genotype–Phenotype Map of Cross-Resistance in HIV-1.” Molecular Biology and Evolution 33, no. 12 (December 2016): 3213–25. [Source]

Hoekstra, H. E. “Genetics, Development and Evolution of Adaptive Pigmentation in Vertebrates.” Heredity 97, no. 3 (September 2006): 222–34. [Source]

Phillips, Patrick C. “Epistasis—the Essential Role of Gene Interactions in the Structure and Evolution of Genetic Systems.” Nature Reviews. Genetics 9, no. 11 (November 2008): 855–67. [Source]