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액체 크로마토그래피, 질량 분석법 및 생물정보학에 의한 펩티도글리칸의 반정량 분석
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生物化学
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JoVE 杂志 生物化学
Semi-Quantitative Analysis of Peptidoglycan by Liquid Chromatography Mass Spectrometry and Bioinformatics
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액체 크로마토그래피, 질량 분석법 및 생물정보학에 의한 펩티도글리칸의 반정량 분석

DOI:
10.3791/61799-v

•

09:09 min

•

October 13, 2020

•

, , ,
1Department of Molecular and Cellular Biology,University of Guelph, 2Mass Spectrometry Facility,University of Guelph

Chapters

  • 00:05Introduction
  • 01:07Peptidoglycan Sacculi Extraction
  • 03:17Liquid Chromatography-Mass Spectrometry (LC-MS) Chromatogram Spectral Processing
  • 04:11Differential Spectral Feature Analysis
  • 05:06Muropeptide Annotation Spectral Features
  • 06:18Muropeptide Global Change Modification Assessment
  • 07:07Results: Representative Muropeptide Fragmentation and Identification and Peptidoglycan Composition Analysis
  • 08:31Conclusion

Summary

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이 프로토콜은 고급 특징 추출 및 생물정보학 분석 소프트웨어와 결합된 액체 크로마토그래피 질량분석법을 사용하여 펩티도글리칸 조성에 대한 자세한 분석을 다룹니다.

Tags

PeptidoglycanMass SpectrometryBioinformaticsPeptidoglycomicsSacculi ExtractionSDS TreatmentEnzymatic DigestionLiquid Chromatography-mass Spectrometry

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