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从土壤、根际和根 Endosphere 提取细菌群落数据的根菌群探析
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JoVE 杂志 遗传学
Exploring the Root Microbiome: Extracting Bacterial Community Data from the Soil, Rhizosphere, and Root Endosphere
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从土壤、根际和根 Endosphere 提取细菌群落数据的根菌群探析

DOI:
10.3791/57561-v

•

09:55 min

•

May 02, 2018

•

, , ,
1Department of Plant and Microbial Biology,University of California, Berkeley, 2Plant Gene Expression Center,USDA ARS

Chapters

  • 00:05Title
  • 00:46Collection and Separation of Root Endosphere, Rhizosphere, and Soil Samples
  • 02:47DNA Extraction
  • 04:11Amplicon Library Preparation and Submission
  • 08:21Results: Effective DNA Amplification
  • 09:10Conclusion

Summary

自动翻译

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在这里, 我们描述了获取土壤、根际和根 endosphere 微生物的扩增子序列数据的协议。该信息可用于研究植物相关微生物群落的组成和多样性, 适合广泛的植物种类使用。

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Root MicrobiomeSoilRhizosphereRoot Endosphere16S Ribosomal RNA GeneCommunity ProfilingMicrobial EcologyDNA ExtractionSequencing LibrarySoil CoreRhizosphere SeparationRoot WashingDNA Extraction

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